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[CP2K] 安装CP2K前安装MKL数学库时出现错误怎么解决?

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安装CP2K前安装MKL数学库时,运行dnf install intel-mkl命令时,出现Error: Failed to download metadata for repo 'intel-mkl-repo': repomd.xml GPG signature verification error: Bad GPG signature,是什么问题,怎么解决呢?

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发表于 Post on 2023-10-3 20:33:01 | 只看该作者 Only view this author
若在集群上,往往管理员已事先安装好(运行module avai查看是否有安装好的Intel MKL可直接加载),甚至可直接使用(运行echo $MKLROOT查看当前机器是否已有Intel MKL生效)。若无直接可用版本,也可下载离线安装包自行安装,资源见http://bbs.keinsci.com/thread-11614-1-1.html
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发表于 Post on 2023-10-3 21:43:19 | 只看该作者 Only view this author
一般情况根本没必要安MKL,下文说了
CP2K第一性原理程序在CentOS中的简易安装方法
http://sobereva.com/586http://bbs.keinsci.com/thread-21608-1-1.html

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-10-3 22:20:44 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-10-3 21:43
一般情况根本没必要安MKL,下文说了
CP2K第一性原理程序在CentOS中的简易安装方法
http://sobereva.com/5 ...

在CP2K安装时也有错误,出现ERROR: (./scripts/install_gcc.sh) cannot find gfortran后,运行dnf install gcc-gfortran装gfortran编译器时,出现Error: Failed to download metadata for repo 'intel-mkl-repo': repomd.xml GPG signature verification error: Bad GPG signature。(以前未出现该问题,今天安装刚出现。)通过下载安装包gcc-10.1.0的方式安装编译器后,在安装Installing OpenMPI时出现:
configure: error: Could not run a simple Fortran program.  Aborting.
make: *** No targets specified and no makefile found.  Stop.
make: *** No rule to make target 'install'.  Stop.
请问这有解决方法吗?

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发表于 Post on 2023-10-4 09:50:49 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 abin 于 2023-10-4 09:52 编辑

签名失效,是某个repo的加密检验失效

可以在repo中,修改
gpgcheck=0
大概如此……

或者使用OneAPI

或者使用我提供的下载即用版本……
https://gitee.com/hpc4you/apps

不过,我相信自己可以搞定


High-Performance Computing for You
为您专属定制的高性能计算解决方案

更多讯息,请访问:
https://labitc.top
http://tophpc.top:8080
电邮: ask@hpc4you.top

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发表于 Post on 2023-10-4 12:14:59 | 只看该作者 Only view this author
Wenchuan 发表于 2023-10-3 22:20
在CP2K安装时也有错误,出现ERROR: (./scripts/install_gcc.sh) cannot find gfortran后,运行dnf instal ...

2 楼已经问过一次了,这里我再问一遍。你是在超算集群里安装? 还是在自己的电脑里安装?

如果是在超算集群,那么这些 MKL, gcc, gfortran 往往都已经安装好了,你只需要调用即可。

如果是在自己的电脑里安装,可能需要更换一下源。可以在网上搜一下“更换阿里源”,“更换华为源”之类的,然后再安装。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-10-4 21:30:11 | 只看该作者 Only view this author
感谢各位的回答,下载intel-mkl.repo文件,https://yum.repos.intel.com/mkl/setup/intel-mkl.repo,将repo_gpgcheck=1改为repo_gpgcheck=0,运行dnf config-manager --add-repo intel-mkl.repo即可解决问题。

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