怎么用GaussView切Pt(111)晶面？

WOOOOWOOOO · 发表于 Post on 2024-4-20 15:20:23

想请教①怎么让盒子边上的原子显示出来，选PBC里“Show All Boundary Atoms”边上原子都是小十字。②由于(111)晶面是斜的，扩胞之后原子太多不知道从哪里开始切，看久了也容易删错原子。有什么技巧方便切出来。

Freeman · 发表于 Post on 2024-4-20 15:50:11

本帖最后由 Freeman 于 2024-4-20 15:51 编辑

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点选Show All Boundary Atoms，并选择其他的Replicate contents display。

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一开始先不要扩胞，就一个晶胞。切的时候，在Reduce页面选择From reference and neighbour cells或者From reference and other visible cells。然后你会看见一个由四条彩色线围成的半透明菱形，以及平行于这个菱形的一层层原子。你挑选相邻的三层或六层原子，其他的层都删掉，就是你要的晶面了。这时再扩胞。

WOOOOWOOOO · 发表于 Post on 2024-4-20 16:02:47

Freeman 发表于 2024-4-20 15:50
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点选Show All Boundary Atoms，并选择其他的Replicate contents display。

谢谢！请问这个Replicate contents display在哪里，没找到。

Freeman · 发表于 Post on 2024-4-20 16:42:26

WOOOOWOOOO 发表于 2024-4-20 16:02
谢谢！请问这个Replicate contents display在哪里，没找到。

就在show all boundary atoms同一页

WOOOOWOOOO · 发表于 Post on 2024-4-20 17:45:15

Freeman 发表于 2024-4-20 16:42
就在show all boundary atoms同一页

谢谢，理解了。现在由图1的状态选择From reference and neighbour cells后l值怎么变成0了呀（图2）。原本的半透明三角形是111晶面，现在有条半透明的线是什么呢？111晶面是由红线和绿线组成的面吗？那图3中我画出来的几个面是平行于111的晶面吗？

Freeman · 发表于 Post on 2024-4-20 21:14:11

因为你切了晶面之后，他就不是三维周期性体系，而是二维周期性体系了，所以第三个米勒系数就没了。
我也不知道半透明的线是干啥的。总之四条彩色的线的意思是，你可以沿这些线的两个方向扩胞。三维还有条蓝线的，到了二维就没了，因为晶面是二维周期性体系，你就不能沿着第三个方向扩胞了。
这些都是Pt(111)的晶面。看你的模型slab要厚一点还是薄一点。厚的就用六层，薄的就用三层。但是不能用除了三和六的其他层数，因为由图可见Pt本身就是ABC堆叠的，必须三层三层一块儿。对于Pt这个简单的例子，每一层都一样，不过多元素的情况，每一层可能不一样，你还得看要让哪一层暴露在最外面。

sobereva · 发表于 Post on 2024-4-21 04:41:00

有半透明的线是因为当前已经变为了二维周期性，它体现的是你现在设的(h,k)=(1,1)

WOOOOWOOOO · 发表于 Post on 2024-4-21 14:22:34

Freeman 发表于 2024-4-20 21:14
因为你切了晶面之后，他就不是三维周期性体系，而是二维周期性体系了，所以第三个米勒系数就没了。
我也不 ...

懂了！谢谢老师呀！

WOOOOWOOOO · 发表于 Post on 2024-4-21 14:22:45

sobereva 发表于 2024-4-21 04:41
有半透明的线是因为当前已经变为了二维周期性，它体现的是你现在设的(h,k)=(1,1)

谢谢，谢谢！

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[建模与可视化] 怎么用GaussView切Pt(111)晶面？