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[新手求助] 关于计算大体系配合物的pKa求助

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楼主
本帖最后由 达斯维达尼亚 于 2022-2-22 21:15 编辑

请教各位老师们,本人想依次计算带四个羧基的配合物的三个pKa(90个原子,含1个Fe,开壳层体系),在看了一些文献以及看了论坛上的一些问答之后,计划用B3LYP带溶剂模型SMD优化分子结构并进行振动分析,用DLPNO-CCSD(T)计算气相单点能,再用优化的结构算溶解自由能(M05-2X,6-31Gd),最后用得到的能量进行计算。我的问题有两个:
1、当优化A-结构时基组需要加弥散函数吗?还是说几个结构需要保持一致的计算级别?
2、经验判断DLPNO-CCSD(T)能算的动我的体系吗?看到论坛上的大佬说算得动100个原子,但是我进行了尝试,36核intel,算了一天多还没算完,还经常崩溃,如果说这个方法算不动的话,大家有没有推荐的其他较为准确的方法呢?
先拜谢各位大佬!



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发表于 Post on 2022-2-22 21:12:35 | 只看该作者 Only view this author
1 用6-311G*,局部带大量负电荷的地方可以再带上弥散。

2 跟你的内存量和基组有关。“能不能算得动”这种事的答案对具体计算条件和计算资源极度敏感。不重要的地方可考虑用小基组节约时间和内存开销。
不要用“优化气相单点能”这种莫名其妙的表述
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-2-22 21:22:25 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-2-22 21:12
1 用6-311G*,局部带大量负电荷的地方可以再带上弥散。

2 跟你的内存量和基组有关。“能不能算得动”这 ...

1、好的谢谢社长!
2、我的计算机是36核128GB,orca的关键词是DLPNO-CCSD(T) normalPNO RIJK def2-TZVPP def2/JK def2-TZVPP/C

(语言习惯不好,已改)

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发表于 Post on 2022-2-22 22:35:22 | 只看该作者 Only view this author
达斯维达尼亚 发表于 2022-2-22 21:22
1、好的谢谢社长!
2、我的计算机是36核128GB,orca的关键词是DLPNO-CCSD(T) normalPNO RIJK def2-TZVPP ...

DLPNO-CCSD(T)算大体系极耗内存,128GB的情况下并行的核数很有限,建议还是考虑双杂化泛函,结合QZ档次的基组算这个也不费劲
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-2-23 13:56:10 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-2-22 22:35
DLPNO-CCSD(T)算大体系极耗内存,128GB的情况下并行的核数很有限,建议还是考虑双杂化泛函,结合QZ档次的 ...

好的 谢谢社长的答复。

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