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[Molclus] molclus结合Gaussian做DFT计算molclus无法启动

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本帖最后由 种子123 于 2022-2-23 11:16 编辑

求教各位前辈,我在学习sob老师的“[Molclus] genmer:生成团簇初始构型结合molclus做团簇结构搜索的超便捷工具 ”时在步骤5.3(做molclus结合Gaussian做DFT计算)遇到了问题,在改完Gaussian的模板输入文件后,点击molclus没有反应、无法启动,isomers文件为空。自己也看了一些帖子,但是完全找不到解决方法,不知道有没有前辈可以帮忙看看。附件是把4.8节得到的Li6团簇初猜构型的traj.xyz。 traj.xyz (21.05 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)


template1.png (15.8 KB, 下载次数 Times of downloads: 32)

template1

template1

template2.png (15.33 KB, 下载次数 Times of downloads: 50)

template2

template2

settings.png (115.02 KB, 下载次数 Times of downloads: 39)

settings

settings

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-2-23 11:17:39 | 只看该作者 Only view this author
sob老师的那篇帖子链接是http://bbs.keinsci.com/thread-2369-1-1.html

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-2-23 11:46:05 | 只看该作者 Only view this author
找到一篇帖子http://bbs.keinsci.com/thread-9962-1-3.html,按4楼sob老师说的“先进入cmd(windows的命令行环境),执行molclus”是下图这样的,好像是说找不到traj.xyz,但是这个xyz文件我已经放在molclus目录下了,不知道下面该怎么办了。

cmd.png (25.08 KB, 下载次数 Times of downloads: 46)

cmd.png

路径.png (16.27 KB, 下载次数 Times of downloads: 28)

路径.png

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发表于 Post on 2022-2-23 14:53:10 | 只看该作者 Only view this author
有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充,应直接编辑原帖,不要通过回帖进行补充,这点在置顶的新社员必读贴里明确说了。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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发表于 Post on 2022-2-23 14:53:47 | 只看该作者 Only view this author
种子123 发表于 2022-2-23 11:46
找到一篇帖子http://bbs.keinsci.com/thread-9962-1-3.html,按4楼sob老师说的“先进入cmd(windows的命令 ...

明显traj.xyz不在当前目录下
当前目录是C:\Users\admin,屏幕上显示得清清楚楚
都是最基本计算机常识问题
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-2-23 16:19:41 | 只看该作者 Only view this author
啊,不好意思,确实是我疏忽了,我再去仔细看看新社员必读贴。我把molclus整个文件夹放在当前目录下就可以打开molclus了,非常感谢sob老师。

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