py.Aroma: 芳香性计算辅助工具

wangzhe

本人之前练习编程的时候写过几个NICS分析的辅助程序，用来生成Gaussian输入文件以及处理其输出文件。后来将这些脚本整合到了一个程序里，命名为py.Aroma。

最近将py.Aroma更新了一下，决定借这个平台宣传一下。

程序由python编写，使用PyQt6作为GUI，同时使用了NumPy, Matplotlib, NetworkX, Openpyxl库。提供打包好的Mac .app和Windows .exe程序，可下载后直接运行。

程序主页：https://wongzit.github.io/program/pyaroma/

下载地址：https://wongzit.github.io/program/pyaroma/download/

主要功能如下：

• 绘制BLA
• 自动识别分子内的环状结构，并计算HOMA（不需要指定原子序号）
• 计算POAV
• NICS：一键为分子内所有环状结构添加Bq原子
• 为扭曲环以及环平面不与XY面平行的环计算NICS_ZZ
• NICS Scan
• 2D/3D NICS（ICSS）
• NICS积分（INICS）
• NMR：允许用户使用标度法或者设置reference并绘制NMR图谱
• 自动生成Supporting information
  

更详细的介绍欢迎阅读用户手册。

下面是几张截图，供参考。




PS：上图里的hf/sto-3g只是用来测试的，并非正经的计算

xxxhhh

你好，我课题组最近在算杯吡咯衍生物，其中有一些环明显偏离重原子平均平面。
我注意到这款软件自4.0其支持倾斜环的NICS，但主页提供的Windows版我这边下载不了，GitHub网站的发行页也只有源代码。请问能否在GitHub网站的发行页上也提供.exe文件的下载？
另外，课题组算的有些中间体的金属配合物的中心金属明显偏离配位原子所在平均平面，因此在这些配位原子的几何中心也加了Bq原子，请问选择倾斜环的时候能否以Bq原子作为多边形顶点？

wangzhe

xxxhhh 发表于 2024-10-5 14:58
你好，我课题组最近在算杯吡咯衍生物，其中有一些环明显偏离重原子平均平面。
我注意到这款软件自4.0其支 ...

github的文件上传有size限制，可以向我发邮件索要。