计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 5721|回复 Reply: 2
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Gaussian/gview] Gaussian计算初始构型得电子到末态,算出的能量与预期不符,而且过渡态没有负的虚频

[复制链接 Copy URL]

4

帖子

0

威望

251

eV
积分
255

Level 3 能力者

本帖最后由 Shuhan_Lu 于 2022-2-28 20:28 编辑

想重复文献( http://dx.doi.org/10.1002/cssc.201601356)里氟代碳酸乙烯酯(FEC)的单电子/双电子还原过程。比如构型47得电子到构型49,文献里49的能量比47高。而我算的47能量=-441.767071Hartree,49能量=-441.840309,明显是49能量远低于47。其它有些构型也有类似情况(其他构型的能量见图片,能量都取自输出文件里的Sum of electronic and thermal Free Energies)。47的构型是从网上找的FEC优化后得到的(#p opt freq b3lyp/6-311+g(d,p) scrf=(solvent=generic,read,pcm) empiricaldispersion=gd3bj)。不知道是47的构型没优化好还是加电子的方法不对(我是通过在gjf文件里改电荷的数值实现的)。另外几个过渡态虚频算出来没有负值,跟文献也不一样。47、49、TS11的输入、输出文件在附件里。Gaussian初学者,面临毕业,谁能帮忙解答下,万分感激!

想要重复的FEC得电子过程.jpg (214.85 KB, 下载次数 Times of downloads: 12)

想要复现的FEC得电子过程

想要复现的FEC得电子过程

文献里对47到49的表述.jpg (90.59 KB, 下载次数 Times of downloads: 9)

文献里对47到49的表述

文献里对47到49的表述

屏幕截图 2022-02-28 193958.jpg (210.42 KB, 下载次数 Times of downloads: 19)

本人计算的各状态能量值

本人计算的各状态能量值

47的输入文件.jpg (90.31 KB, 下载次数 Times of downloads: 17)

47的输入文件

47的输入文件

49的输入文件.jpg (90.69 KB, 下载次数 Times of downloads: 12)

49的输入文件

49的输入文件

47.gjf

915 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 1

47输入文件

47_log.rar

77.05 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

47输出文件

49.gjf

916 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 0

49输入文件

49_log.rar

98.19 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

49输出文件

TS11.gjf

910 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 1

TS11输入文件

TS11.log

181.67 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

TS11输出文件

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125208

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2022-3-2 03:22:58 | 只看该作者 Only view this author
要和文献比就用和文献精确相同的计算级别和设置
如果精确相同了,而且也确信没其它不符的地方(几何结构、程序版本等),直接发邮件问作者
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

4

帖子

0

威望

251

eV
积分
255

Level 3 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-3-17 18:37:20 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-3-2 03:22
要和文献比就用和文献精确相同的计算级别和设置
如果精确相同了,而且也确信没其它不符的地方(几何结构、 ...

谢谢老师回复,现在在用相同精度试试,

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-28 00:45 , Processed in 0.170826 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list