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[CP2K] 求助:小体系跑NPT系综的AIMD判断是否平衡拿捏不准

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老师、同学们大家好!
尝试用cp2k做AIMD有些问题向大家求助:
1、如果希望跑NPT系综的AIMD,模型的分子数一定要较大才可行吗?一般多大比较合适?
2、我也尝试做了一个NPT系综的模拟,100个N2分子。在判断体系是否平衡的时候拿捏不准。附图中是体系的压力、温度以及盒子体积,似乎一直存在波动,平衡得不太理想。请问这种波动幅度是否能接受?
3、我琢磨了一下,一方面可能是我MD Section的TIMECON参数不够合理?这两个参数我取得没有依据,请问是否有建议值或者是否需要测试、尝试?另一方面可能是我设置的MD温度太低。我理想化地采用了液氮的常压沸点77K,但似乎为了更快平衡,连常温的模拟都会人为地提高些温度,我在低温下模拟的轨迹导入VMD后发现N2分子动作很缓慢,请问我这样用很低的温度模拟是否不合理?

附MD Section:
&MD
    ENSEMBLE NPT_I
    STEPS 5000
    TIMESTEP 1.0
    TEMPERATURE 77
    &THERMOSTAT
      TYPE CSVR
      &CSVR
        TIMECON 10
      &END CSVR
    &END THERMOSTAT
    &BAROSTAT
      PRESSURE 1.01325
      VIRIAL XYZ
      TIMECON 50
    &END BAROSTAT
&END MD


谢谢老师和同学们的帮助!

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发表于 Post on 2022-3-26 14:28:06 | 只看该作者 Only view this author
1 说清楚具体体系

2 看下文的讨论
谈谈怎么判断分子动力学模拟是否达到了平衡
http://sobereva.com/627http://bbs.keinsci.com/thread-27122-1-1.html
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