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[GROMACS] 求助:从轨迹文件中提取信息时出现错误

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楼主
求助各位老师:
我使用命令:gmx trjconv -f ***.xtc -s ***.tpr -n ***.ndx -o ***.pdb,我想从轨迹文件(我的mdp文件一共10000000步,每1000步输出一次坐标信息到xtc文件中)中提取某一组原子的坐标,gromacs运行过程中出现:WARNING: Incomplete frame: nr 2972 time 2972。请问各位老师,这个警告出现的原因是什么?有什么解决办法吗?

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发表于 Post on 2022-3-28 11:55:28 | 只看该作者 Only view this author
你看看VMD能否顺利载入轨迹,如果不能,或者轨迹有的帧异常,可能轨迹文件被破坏了
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-3-28 14:00:53 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-3-28 11:55
你看看VMD能否顺利载入轨迹,如果不能,或者轨迹有的帧异常,可能轨迹文件被破坏了

谢谢老师,我使用vmd无法正常显示全部轨迹,我准备重新计算这一部分数据了。

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