求助：膜+蛋白体系在 NPT阶段出现warning且卡住不动

crush · 发表于 Post on 2022-4-1 21:20:57

本帖最后由 crush 于 2022-4-1 21:24 编辑

我在模拟膜蛋白体系进行到 NPT阶段时输入运行命令：nohup gmx mdrun -deffnm npt -nt 8 -pin on -pinoffset 8 -pinstride 1 -gpu_id 0 -pme gpu &
我使用了8个CPU但是在top后台看到gmx进程只有1个CPU在工作，而且在nohup.out文件以及npt.log文件中也是一直卡在那里。如下图

***************************************

我的mdp参数文件如下：

crush · 发表于 Post on 2022-4-9 10:45:54

已解决

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