请教gmx_mpi select中-selcet选项怎么写选区语句？

灵芝5 · 发表于 Post on 2022-5-28 12:05:00

您好！我在分析一个带NaCl离子的6聚体蛋白的轨迹，现在想选中距离某一条链（假设是A链）8号残基5埃范围内的Cl离子；

想请问一下如果用gmx_mpi select指令的话，-select选项应该怎么写语句可以选中这一范围内的Cl离子？

Frozen-Penguin · 发表于 Post on 2022-5-28 12:31:06

within 0.5 of resnr 8 and name Cl-
选取8号残基附近并且原子名为Cl-的原子

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[GROMACS] 请教gmx_mpi select中-selcet选项怎么写选区语句？