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[Gaussian/gview] 原子数一千多,半经验优化一直失败

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想用半经验简单优化一下,得到mmff94电荷,进而跑动力学模拟,半经验优化 一直失败,降低收敛标准仍然失败。

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发表于 Post on 2025-6-3 18:29:16 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 18217265596 于 2025-6-3 18:30 编辑

这种体系,欢迎拥抱gfnff或者gfn0/1 xtb
算的又快又好
我粗看了一眼 你这全是重复单元 你为什么不按单元算?

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发表于 Post on 2025-6-3 18:31:18 | 只看该作者 Only view this author
聚合物产生电荷的方法是截取片段(例如往往取3个左右的重复单元)产生电荷,不要拿整个聚合物做结构优化、产生电荷,既浪费机时,结果又未必更准。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-6-3 20:29:33 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2025-6-3 18:31
聚合物产生电荷的方法是截取片段(例如往往取3个左右的重复单元)产生电荷,不要拿整个聚合物做结构优化、 ...

聚合物截取重复单元做优化,仅仅为了得到resp电荷,最后做动力学模拟时,其实只要得到resp电荷,就可以直接做动力学模拟,没必要对分子做优化处理。这样理解对吗?谢谢啦

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发表于 Post on 2025-6-3 21:42:36 | 只看该作者 Only view this author
qyl 发表于 2025-6-3 20:29
聚合物截取重复单元做优化,仅仅为了得到resp电荷,最后做动力学模拟时,其实只要得到resp电荷,就可以直 ...

你用gaff就不用
你要自己拟合参数就要

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-6-3 22:45:12 | 只看该作者 Only view this author
18217265596 发表于 2025-6-3 21:42
你用gaff就不用
你要自己拟合参数就要

好的,谢谢啦

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发表于 Post on 2025-6-3 23:05:56 | 只看该作者 Only view this author
MMFF94原子电荷只依赖于连接关系,优化结构毫无意义、完全多余

看此文了解不同原子电荷计算的基本原理
一篇深入浅出、完整全面介绍原子电荷的综述文章已发表!
http://sobereva.com/714http://bbs.keinsci.com/thread-46067-1-1.html

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-6-4 09:25:38 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-6-3 23:05
MMFF94原子电荷只依赖于连接关系,优化结构毫无意义、完全多余

好的,谢谢老师

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发表于 Post on 2025-6-4 20:56:35 | 只看该作者 Only view this author
qyl 发表于 2025-6-3 20:29
聚合物截取重复单元做优化,仅仅为了得到resp电荷,最后做动力学模拟时,其实只要得到resp电荷,就可以直 ...

对。我没注意你需要的是MMFF94电荷,那更是连重复单元优化都不需要
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
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