计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 3196|回复 Reply: 3
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Material Studio] 求助 有关ms计算硼的分子动力学问题

[复制链接 Copy URL]

15

帖子

0

威望

65

eV
积分
80

Level 2 能力者

首先,从materials project网站中导出了硼晶胞的cif文件,并在forcite模块下进行结构优化后,依此搭建了2x2x2的超胞,后对此超胞后进行分子动力学模拟计算,并依此进行晶体生长模拟以及硼表面吸附物质计算,但在退火和分子动力学步骤下发现ms中每个力场下都是计算错误。(导出硼的cif文件和搭建的超胞图片如下)请问是ms中的力场不支持硼的力场参数? 是否需要更换软件计算,或者是否可以手动添加力场参数继续进行计算?

谢谢各位老师指点!

单胞.png (50.77 KB, 下载次数 Times of downloads: 28)

导出硼单胞的cif文件

导出硼单胞的cif文件

超胞.png (87.71 KB, 下载次数 Times of downloads: 32)

搭建的2x2x2超胞

搭建的2x2x2超胞

239

帖子

0

威望

5249

eV
积分
5488

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2022-5-7 21:56:29 | 只看该作者 Only view this author
适用于纯硼的力场极少,经验力场可能只有这个:https://iopscience.iop.org/article/10.1088/0965-0393/23/4/045014
机器学习力场有:https://link.aps.org/doi/10.1103/PhysRevLett.120.156001

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125155

管理员

公社社长

3#
发表于 Post on 2022-5-8 09:40:15 | 只看该作者 Only view this author
建议改用CP2K基于GFN1-xTB跑MD(算得动的话用TPSS泛函跑)。forcite就根本甭指望了
本来体系也没多大,没必要用经验力场
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

15

帖子

0

威望

65

eV
积分
80

Level 2 能力者

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-8 16:23:27 | 只看该作者 Only view this author
get-it 发表于 2022-5-7 21:56
适用于纯硼的力场极少,经验力场可能只有这个:https://iopscience.iop.org/article/10.1088/0965-0393/23/ ...

谢谢老师指点

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-24 04:34 , Processed in 0.229674 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list