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各位老师，大家好，我的一个关于丙酸乙酯（EP）光电离解离的工作，对中性分子EP和光电离得到的分子离子EP+进行了LBO分析，但是审稿人提出了这样一个问题：Sec 3.1 and 3.2. It is clear there is a large difference between the adiabatic and vertical ionization energy of EP. This speaks to a large geometry difference between the neutral and ion. Some of this is discussed with the changing bond lengths. The authors could easily do a Franck Condon simulation (in Gaussian) to see the vibrational excitation that occurs upon ionization and relate this to the changing geometry. It may provide more insight.
审稿人建议进行Franck-Condon因子的计算和分析。针对这个问题，我用Gaussian软件进行了Franck-Condon因子的计算，完整的输入文件和输出文件如附件所示(另外调用的输入文件是第二个结构优化得到的00001-.chk)。
我现在的问题是，
一、审稿人让我补算的具体是Franck-Condon因子的哪些分析呢？
二、对于输入文件部分，我的第二个文件的结构写成分子离子的结构是否正确？我的命令语句是否存在问题？
三、我按照当前的输入文件格式，出现了输出的高斯报错，结构中有两个虚频，我重算了好几遍，没找到出现问题的原因，请问出现报错可能是我的哪些操作有问题呢？
非常感谢各位老师，希望能得到各位老师们的指教！
输入文件：
%chk=000001.chk
#p freq=savenm wb97xd/6-311++g(2df,2p)
000001
0 1
XX
--link1--
%chk=000001-.chk
#p freq=savenm wb97xd/6-311++g(2df,2p) guess=read
000001-
1 2
XX
--link1--
%oldchk=000001.chk
%chk=fc.chk
#p freq=(fc,ReadFCHT) geom=check
FC
0 1
initial=source=calc final=source=chk
spectrum=(lower=-500.,upper=+5000.,grain=1.,HWHM=150)
temperature=value=20
reddim=clearimfreq
prescreening=(maxc1=30.,maxc2=30)
print=matrix=JK
000001-.chk
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发表于 Post on 2024-11-7 00:10:20
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楼主 Author
发表于 Post on 2024-11-9 07:20:42