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[GROMACS] 求助均相混合体系跑npt系综中途报错

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我的体系:几种有机小分子均相混合体系,跑完em、nvt之后准备跑npt系综(设置了一个773k到373k的退火),npt系综共设置1亿步,正常计算到37w步后报错(错误为:Fatal error:Too many LINCS warnings (1000) If you know what you are doing you can adjust the lincs warning threshold in your mdp file or set the environment variable GMX_MAXCONSTRWARN to -1, but normally it is better to fix the problem)。报错之后我的尝试:我把步长缩小为原来的一半,还是报错。求助各位老师,除了改变步长之外,我还能从哪几个方面排查问题,出现这种中途报错可能的原因是什么。


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发表于 Post on 2022-5-11 12:26:57 | 只看该作者 Only view this author
可以看sobtop的FAQ8一一排除http://sobereva.com/soft/Sobtop/#FAQ

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-11 16:30:44 | 只看该作者 Only view this author
高处裹棉被 发表于 2022-5-11 12:26
可以看sobtop的FAQ8一一排除http://sobereva.com/soft/Sobtop/#FAQ

感谢帮助!

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