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[其它程序] 在GROMOS54A7力场下生成坐标文件时遇到的问题

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大家好,我在使用gromos程序pdb2g96时遇到了一些问题,在使用经过处理的pdb文件时系统会提示无法发现一些氨基酸残基的原子,所以将这些原子的坐标设置为(0.0,0.0,0.0),如图所示 ,遇到这样的问题应该怎么解决呢?希望大家有时间可以帮忙解答一下,非常感谢。

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发表于 Post on 2022-5-12 20:35:08 | 只看该作者 Only view this author
为什么不用GROMACS?
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-12 20:52:03 | 只看该作者 Only view this author
老板让用这个,我这研一萌新也不好说啥,希望老师您能帮我指点一二

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发表于 Post on 2022-5-15 23:47:21 | 只看该作者 Only view this author
MELO 发表于 2022-5-12 20:52
老板让用这个,我这研一萌新也不好说啥,希望老师您能帮我指点一二

GROMOS的用户数连GROMACS的百分之一都不到
用GROMOS没前途,遇到问题能给你解答的人都很难遇到
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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