计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 118|回复 Reply: 0
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[GROMACS] 求助,如何理解不同小分子与界面间的自由能大小关系(伞型采样计算PMF)?

[复制链接 Copy URL]

34

帖子

0

威望

447

eV
积分
481

Level 3 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
各位老师,我最近做一些小分子在石墨烯类材料表面的吸附模拟:
1、用伞型采样计算了小分子与石墨烯吸附到解吸附过程的自由能,结果发现,苯酚>甲苯>苯,这是否意味着分子与石墨烯的结合能力也符合此顺序?
2、将这些分子混合,考虑其在石墨烯表面竞争吸附的成品模拟,发现石墨烯表面被甲苯与苯分子占据,苯酚分子更倾向于越过周期性边界条件吸附于对侧石墨烯表面,或者吸附在甲苯与苯分子上。这是否意味着甲苯与苯分子与石墨烯的结合能力(竞争性)更强?
3、如何理解成品模拟现象与自由能计算结果的差异性?是否矛盾?

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-1-24 07:43 , Processed in 0.179218 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list