计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 2773|回复 Reply: 5
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Multiwfn使用咨询] 绘制苯的分子平面上方1埃处的Z方向磁屏蔽值的填色图,没出现图?

[复制链接 Copy URL]

249

帖子

0

威望

1254

eV
积分
1503

Level 5 (御坂)

争取学好计算化学!

本帖最后由 wy标点人生 于 2021-10-22 22:24 编辑

老师,我按照博文上来绘制苯的分子平面上方1埃处的Z方向磁屏蔽值的填色图,没出现您博文上的图。出现的图如下,主要是不知道怎么设置有些参数。老师,我是按照下面在Multiwfn里输入的:

启动新的Multiwfn,然后输入
ICSSZZ.cub
4    //绘制平面图
100     //自定义函数。此时这个函数在任意一点的数值即是基于ICSSZZ.cub插值得到的值
1    //填色图
[回车]
1    //XY平面
1.89    //Z=1.89 Bohr,相当于Z=1埃
在刚出现的图上点右键关闭之,并输入
1    //更改色彩刻度
-40,30
4    //显示原子标号
1    //文字为红色
17    //设定显示文字的距离阈值
2     //只要原子核距离作图平面小于2埃则这个原子的符号就显示在图上
n
2    //显示等值线
-1    //重新作图
此时会看到下图

把“1    //更改色彩刻度-40,30”,改成了-5,40;
“17    //设定显示文字的距离阈值,2     //只要原子核距离作图平面小于2埃则这个原子的符号就显示在图上”      不知道是否需要修改?
然后就出现了下面的图(没有图像,还坐标数字重叠)。
老师,上传的图片可以缩小吗?太大太占空间了。

1.png (30.15 KB, 下载次数 Times of downloads: 16)

1.png

2.png (64.18 KB, 下载次数 Times of downloads: 15)

2.png
始终相信生活美好,万物可爱!

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112354

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2021-10-23 01:33:09 | 只看该作者 Only view this author
你先严格把此文里的例子精确重复一遍(所有命令精确照着敲一遍,体会、理解每一步的含义),重复成功之前不要做任何自由发挥
通过Multiwfn绘制等化学屏蔽表面(ICSS)研究芳香性
http://sobereva.com/216

绘制平面图诸多细节在此文4.2节都有说明,仔细看一遍
Multiwfn FAQ
http://sobereva.com/452

想缩小图像你用photoshop、irfanview之类图像编辑/观看程序改就完了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

249

帖子

0

威望

1254

eV
积分
1503

Level 5 (御坂)

争取学好计算化学!

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-10-24 09:47:50 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wy标点人生 于 2021-10-24 14:09 编辑
sobereva 发表于 2021-10-23 01:33
你先严格把此文里的例子精确重复一遍(所有命令精确照着敲一遍,体会、理解每一步的含义),重复成功之前不 ...

好的,谢谢卢老师!已经绘制出来了,但是出现右边纵坐标乱码。就是上面第二幅图右边那种坐标的情况,我再试试。
始终相信生活美好,万物可爱!

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112354

管理员

公社社长

4#
发表于 Post on 2021-10-26 14:55:24 | 只看该作者 Only view this author
wy标点人生 发表于 2021-10-24 09:47
好的,谢谢卢老师!已经绘制出来了,但是出现右边纵坐标乱码。就是上面第二幅图右边那种坐标的情况,我再 ...

那明显不是什么乱码,而是标签间隔设得太小。把间隔改大就完了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

249

帖子

0

威望

1254

eV
积分
1503

Level 5 (御坂)

争取学好计算化学!

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-10-26 20:30:16 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-10-26 14:55
那明显不是什么乱码,而是标签间隔设得太小。把间隔改大就完了

嗯嗯,好的,谢谢老师!
始终相信生活美好,万物可爱!

8

帖子

0

威望

104

eV
积分
112

Level 2 能力者

6#
发表于 Post on 2022-5-25 16:04:53 | 只看该作者 Only view this author
你好,请问你这个问题是怎么解决的?

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-24 04:29 , Processed in 0.168468 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list