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[ORCA] ORCA计算分子轨道能级,怎么指定计算某两个原子间的电子轨道能级

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请问ORCA计算分子轨道能级,希望指定计算某两个原子间的电子轨道能级(体系较大),指定原子的语句在输入文件中怎么写,在手册中没找到……;另外,请问各位都是怎么登上orca的官网的……我特殊姿势上网也进不去……

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发表于 Post on 2022-5-28 20:57:08 | 只看该作者 Only view this author
分子轨道都是离域在整个分子上的,没有”某两个原子间的电子轨道能级“这个概念。
如果你是从某篇文献看到的这个概念,贴文献原文上来。如果不是从文献看来的而是自己发明的概念,说明一下你为什么想算这个,我们看看可以用什么计算来替代。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
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发表于 Post on 2022-5-28 21:03:22 | 只看该作者 Only view this author
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并清楚、准确反映出帖子具体内容,避免有任何歧义,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题“Orca输入文件”改了,以后务必注意,下次将删帖+扣分处理
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
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发表于 Post on 2022-5-28 21:05:09 | 只看该作者 Only view this author
至少我发帖的此时此刻,在大陆以外地区访问ORCA论坛是正常的。既可能你赶巧正好论坛有问题,要么就是姿势不对。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-28 21:07:31 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-5-28 21:03
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此 ...

抱歉抱歉,谢谢社长,下次一定注意!!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-28 21:25:31 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Apethie 于 2022-5-28 21:30 编辑
wzkchem5 发表于 2022-5-28 20:57
分子轨道都是离域在整个分子上的,没有”某两个原子间的电子轨道能级“这个概念。
如果你是从某篇文献看到 ...

谢谢您,我是想画分子轨道杂化图(类似附件图片),因此想计算一下某两个原子之间的轨道大致分布,来做个参考。
图片来自C:\Users\Irene\Desktop\11.pngJ. Phys. Chem. C 2014, 118, 14, 7630–7636

202205282129011924..png (232.78 KB, 下载次数 Times of downloads: 24)

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发表于 Post on 2022-5-28 21:33:31 | 只看该作者 Only view this author
Apethie 发表于 2022-5-28 14:25
谢谢您,我是想画分子轨道杂化图(类似附件图片),因此想计算一下某两个原子之间的轨道大致分布,来做个 ...

实际体系里面,所有Mn的轨道和所有Se的轨道都会杂化,得到很多离域在整个体系上的分子轨道(也就是所谓的正则轨道canonical molecular orbital)。文献图上只画了一个Mn和一个Se是简略的画法,并不表示每个Mn只和一个Se发生轨道杂化。这个多看一些配体场理论的书就会知道,比如一个八面体配合物,金属是和6个配体的轨道同时杂化的。另外建议仔细看一下分子轨道理论方面的内容,有的课本在讲分子轨道理论的时候举的例子全是双原子分子,给人一种分子轨道总是两个原子参与杂化的错觉,但是那些讲得深一点的教材一定会告诉你,当原子数不止两个的时候,分子轨道是什么样的。然后你就会发现,几乎所有原子都参与杂化,一个分子有100个原子,可能每个轨道平均能有95个原子参与杂化。
所以直接算整个体系的分子轨道就行了,不能也不需要选两个原子。
Zikuan Wang
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-28 22:15:56 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-5-28 21:05
至少我发帖的此时此刻,在大陆以外地区访问ORCA论坛是正常的。既可能你赶巧正好论坛有问题,要么就是姿势不 ...

明白啦,谢谢社长

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-28 22:21:25 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-5-28 21:33
实际体系里面,所有Mn的轨道和所有Se的轨道都会杂化,得到很多离域在整个体系上的分子轨道(也就是所谓的 ...

由于我的体系有一百多个原子,计算分子轨道的话输出数据应该会特别长,只能进行一定参考。还是说没有计算的必要,应该尝试从其他方面分析,谢谢您

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发表于 Post on 2022-5-29 00:36:32 | 只看该作者 Only view this author
Apethie 发表于 2022-5-28 15:21
由于我的体系有一百多个原子,计算分子轨道的话输出数据应该会特别长,只能进行一定参考。还是说没有计算 ...

输出数据长是正常的。找到前线轨道,分析每个原子的原子轨道对前线轨道的贡献,就行了。这个不需要去输出文件里找轨道系数,用Multiwfn等软件打开molden文件分析轨道系数也可以
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Apethie 发表于 2022-5-28 22:21
由于我的体系有一百多个原子,计算分子轨道的话输出数据应该会特别长,只能进行一定参考。还是说没有计算 ...

Multiwfn载入ORCA的molden文件后,既可以输出你指定的轨道中各个原子的贡献,也可以计算你指定的原子对各个轨道的贡献,得到你感兴趣的信息很容易

谈谈轨道成份的计算方法
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wzkchem5 发表于 2022-5-29 00:36
输出数据长是正常的。找到前线轨道,分析每个原子的原子轨道对前线轨道的贡献,就行了。这个不需要去输出 ...

哇,明白了,谢谢您

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-29 12:53:50 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-5-29 01:38
Multiwfn载入ORCA的molden文件后,既可以输出你指定的轨道中各个原子的贡献,也可以计算你指定的原子对各 ...

嗯嗯,明白啦,谢谢社长

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