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[Multiwfn使用咨询] 请教一下制作IRI平面填色图时如何调整分子朝向变成案例中的垂直方式

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      我在做一个分子的IRI平面填色图时,按照sobereva老师博文中的方法最后显示为图a,感觉太别扭了,想请教一下,能否在Multiwfn中调整分子结构朝向变成图b类似博文中案例的样子?之前画的一个类似结构的分子IRI平面填色图是和博文中的案例一样是垂直朝向,另外,我用GView查看了一下opt优化好的分子结构图,发现分子显示的结构朝向就是水平方向(图c)不是垂直方向(图d),是不是需要gaussian重新调整结构再计算?

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发表于 Post on 2022-5-29 01:10:57 | 只看该作者 Only view this author
Multiwfn绘制平面图的功能已经支持对绘制内容平移和旋转
http://bbs.keinsci.com/thread-11037-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-29 12:24:56 | 只看该作者 Only view this author
好的,谢谢sobereva老师。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-30 17:11:26 | 只看该作者 Only view this author
请教sobereva老师,按照您博文中的方法,将图b旋转成图a接近水平方向(或者图a转图b),从图中估算四元环中心位置应该不变,旋转6一定角度即可,但是在Multiwfn中输入相应平移量和角度后,方向并没有旋转,我尝试了多种平移量和旋转角度图像也没发生变化,是不是因为作图时选择的是1-XY plane方式而不是4-三个原子方式?我自己试了几中三个原子定义方式也没找到合适的显示效果,没弄明白。。。

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发表于 Post on 2022-6-1 13:07:26 | 只看该作者 Only view this author
食无鱼出无车 发表于 2022-5-30 17:11
请教sobereva老师,按照您博文中的方法,将图b旋转成图a接近水平方向(或者图a转图b),从图中 ...

帖子里写明了
注意这个平移、旋转设定功能仅是对于以模式4、5方式定义作图平面而言的,以其它方式定义作图平面用这个选项无效。
如果你的回帖想引起我的注意,必须点击帖子下面的回复按钮
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-1 15:06:10 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-6-1 13:07
帖子里写明了
如果你的回帖想引起我的注意,必须点击帖子下面的回复按钮


好的,sobereva老师,我理解错成是主功能里面的4了

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