请问能用intel的oneAPI编译gromacs吗？

sun35mr · 发表于 Post on 2022-6-10 00:46:46

我在网上搜索gromacs的linux编译方法，都是用gcc+fftw编译的，请问能用intel的oneAPI编译gromacs吗？
我看官网manual，说用intel编译器的话，需要加上
cmake -DGMX_FFT_LIBRARY=mkl \
-DMKL_LIBRARIES="/full/path/to/libone.so;/full/path/to/libtwo.so" \
-DMKL_INCLUDE_DIR="/full/path/to/mkl/include"
但是我发现我安装的oneAPI根本就没有libone.so和libtwo.so
其实我最关心的是，用oneAPI编译速度会快吗？因为之前用oneAPI编译的VASP和lammps，运行速度确实比gcc快一些，如果对于gromacs来说两者差不多我也就不纠结了。

sobereva · 发表于 Post on 2022-6-10 05:45:32

用oneAPI编译gmx不会带来什么好处

highlight · 发表于 Post on 2022-6-10 09:02:40

哪个版本的 mkl 都没有吧，libone.so 就好比“张三”，只是举个例子而已

sun35mr · 发表于 Post on 2022-6-10 09:29:44

sobereva 发表于 2022-6-10 05:45
用oneAPI编译gmx不会带来什么好处

谢谢啦，那我就用gcc编译了

sun35mr · 发表于 Post on 2022-6-10 09:30:09

highlight 发表于 2022-6-10 09:02
哪个版本的 mkl 都没有吧，libone.so 就好比“张三”，只是举个例子而已

原来是这个意思，难怪我找不到

abin · 发表于 Post on 2022-6-10 11:07:15

如果你追求intel MPI + MKL版本,
这里有.
https://pan.baidu.com/s/1r7PduYXqjn3kpS-ie0H8NQ?pwd=aknc
不过是老版本的 2019.6.

应该只能在Intel平台使用(未严格测试).

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