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[辅助/分析程序] polyrate输入文件.fu40的VVALUE参数设置求助

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请问各位老师们,polyrate的输入文件.fu40中的VVALUE参数的值是用吉布斯自由能呢还是用电子能量呢,手册中只说 it specifies the value of the potential at the reactant, product or saddle point.  多谢

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发表于 Post on 2022-5-24 10:22:32 | 只看该作者 Only view this author
你好,你的问题解决了吗?我这段时间也在写polyrate 的输入文件我想问一下.fu40中的HESSIAN, SMEP, GEMO,GRAD,是从哪里可以获取的呢?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-28 10:24:17 | 只看该作者 Only view this author
提供一下我的做法,以供参考讨论
1. 可以详细地看一下Polyrate的手册,关于参数的含义有解释,如图1。
2. SMEP和VMEP可以看做确定一个点的位置所需要的两个坐标,一个是反应坐标SMEP,一个是能量坐标VMEP。SMEP我是通过IRC曲线上的横坐标值确定的,如图2所示;对于VEMP而言,我是将反应物的能量看作0,求IRC上选取的点和反应物的能量差,这个差就是VEMP。
3. GEOM是坐标,很简单。HESSIAN和GRAD是从频率分析后的.fchk文件文件中获取的,如图3。
4. 关于Polyrate,我也不是特别了解,因为之前的研究,仅仅了解一点点,如果要深入,一定要多看手册关于输入文件部分的介绍。

图1-参数说明.png (263.96 KB, 下载次数 Times of downloads: 19)

图1-参数说明.png

图2-IRC.png (113.2 KB, 下载次数 Times of downloads: 13)

图2-IRC.png

图3-fchk文件.png (81.28 KB, 下载次数 Times of downloads: 15)

图3-fchk文件.png

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