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计算化学公社»论坛首页 › 理论与计算化学 (Theoretical and Computational Chemistry) › 量子化学 (Quantum Chemistry) › 关于激发态质子转移吉布斯自由能计算问题

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[新手求助] 关于激发态质子转移吉布斯自由能计算问题

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楼主

发表于 Post on 2021-10-13 16:45:22 | 只看该作者 Only view this author |只看大图 View big picture 回帖奖励

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老师，您好，我有两个问题请教您：
1.如图寻找激发态质子转移过渡态，虚频振动方向是转移方向。然后跑IRC，如图，IRC上电子质子转移能垒转移能垒为4.53kcal/mol，逆转移能垒是1.52kcal/mol比前面小，是说明质子转移后的异构体比正常结构不稳定吗？
2.搜索完过渡态结构，我想计算异构体结构、过渡态结构、正常结构的吉布斯自由能，以便算自由能垒进一步判断转移机制。根据您的文章《谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算http://sobereva.com/327》结合《使用Shermo结合量子化学程序方便地计算分子的各种热力学数据http://sobereva.com/552》，是分别将三个结构提取出来优化结构后，再计算单点能，得到电子能量值再填写进Shermo程序中吗？还是直接用IRC曲线上点的电子能量值就可以？
麻烦老师啦

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发表于 Post on 2021-10-13 16:58:38 | 只看该作者 Only view this author

1. 对
2. 需要优化结构并在更高级别下算单点能

Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心研究员
BDF（https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html）、ORCA（https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php）开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页：http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
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楼主 Author| 发表于 Post on 2021-10-13 19:00:30 | 只看该作者 Only view this author

wzkchem5 发表于 2021-10-13 16:58
1. 对
2. 需要优化结构并在更高级别下算单点能

谢谢老师，那计算单点能时是如果优化的是基态结构就在此结构基础上算基态的单点能，如果优化的是激发态结构再此结构上求基态单点能还是激发态的单点能？我找的是激发态的过渡态，那这异构体结构，过渡态结构和正常结构三个结构是需要优化激发态结构再高精度计算单点能吗？麻烦老师了

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发表于 Post on 2021-10-13 19:21:11 | 只看该作者 Only view this author

zhb 发表于 2021-10-13 12:00
谢谢老师，那计算单点能时是如果优化的是基态结构就在此结构基础上算基态的单点能，如果优化的是激发态结 ...

都是在激发态结构上算激发态单点能

Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心研究员
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发表于 Post on 2022-9-11 19:53:55 | 只看该作者 Only view this author

wzkchem5 发表于 2021-10-13 19:21
都是在激发态结构上算激发态单点能

老师请问激发态的单点能计算任务是要加TD的关键词吗还是就只写方法和基组就可以了呢

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发表于 Post on 2022-9-11 21:02:39 | 只看该作者 Only view this author

smlscu 发表于 2022-9-11 12:53
老师请问激发态的单点能计算任务是要加TD的关键词吗还是就只写方法和基组就可以了呢

按http://sobereva.com/314的方法计算

Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心研究员
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发表于 Post on 2022-9-11 22:05:46 | 只看该作者 Only view this author

wzkchem5 发表于 2022-9-11 21:02
按http://sobereva.com/314的方法计算

好的谢谢老师

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