计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 8623|回复 Reply: 8
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[波函数分析交流] 使用Multiwfn手撕电荷转移积分(基于FCD方法)

[复制链接 Copy URL]

55

帖子

1

威望

1551

eV
积分
1626

Level 5 (御坂)

本帖最后由 Puying 于 2020-1-7 22:54 编辑

首先看FCD的公式  原文链接: https://doi.org/10.1063/1.1502255
H=(E2-E1)*|△q12)|  /  sqrt[   (△q1-△q2)^2  + 4*△q12^2 ]

比如计算HOMO和HOMO-1轨道之间的电荷转移积分。
E1和E2分别是轨道能量,E2-E1为轨道能量差值。可以通过Multiwfn查看轨道得到轨道能量
△q12为transition charge difference。
△q1-△q2为adiabatic charge difference。
以上两个值可以通过Multiwfn的功能8的轨道分解分析得到

举例(C13H28烷烃二聚体):
                     donor            acceptor
HOMO           97.10%          2.90%
HOMO-1        2.81%            97.19%

以上分别为HOMO和HOMO-1轨道在两个分子上的分布占比,则:
△q1-△q2=(97.10%-2.90%)-(2.81%-97.19%)=1.8858
△q12=sqrt(97.10%*2.90%)+sqrt(2.81%*97.19%)=0.33297
由于E2-E1=0.000149 hartree=0.0040545 eV
则 H=0.0040545*0.33297/sqrt(1.8858^2+4*0.33297^2)=0.675meV     用site energy correction 方法计算的是0.716meV。我也试了其他两三个例子,结果也都差不多

以上是我读了FCD原文加上Multiwfn凑出来算的,不保证正确。。。错了的话原谅我,【捂脸】

评分 Rate

参与人数
Participants 3
eV +7 收起 理由
Reason
youngcosmos + 4
WC130982 + 1 谢谢
ggzggz + 2 赞!

查看全部评分 View all ratings

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112356

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2020-1-7 22:14:13 | 只看该作者 Only view this author
Multiwfn里其实原本直接就有FCD和GMH计算功能,只不过代码完成99%后玩去了,于是一直没显示在主界面里也没写到手册里... 后来把这部分代码挪到一个新坑里了,之后有时间的时候会发布
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

55

帖子

1

威望

1551

eV
积分
1626

Level 5 (御坂)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-1-7 22:44:10 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-1-7 22:14
Multiwfn里其实原本直接就有FCD和GMH计算功能,只不过代码完成99%后玩去了,于是一直没显示在主界面里也没 ...

社长威武!!!

29

帖子

0

威望

125

eV
积分
154

Level 3 能力者

4#
发表于 Post on 2021-10-25 19:31:01 | 只看该作者 Only view this author
老哥,我读了你贴的原文献,看你那意思是说把N聚体的结构扒成一个结构文件,然后一次计算一下单点,最后再mwf提取你说的这些参量,最后扔到公式里手撕一下。是这个意思吗?
我还有个想法,对应空穴的传输就用中性N聚体,要改为研究电子的传输我们给N聚体加上一个电荷,然后自旋多重度改为1,再去算单点,再用mwf分析最高能量那个轨道的参量,再手撕一下,

55

帖子

1

威望

1551

eV
积分
1626

Level 5 (御坂)

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-11-6 20:17:32 | 只看该作者 Only view this author
pizaipizai@5989 发表于 2021-10-25 19:31
老哥,我读了你贴的原文献,看你那意思是说把N聚体的结构扒成一个结构文件,然后一次计算一下单点,最后再m ...

N聚体不晓得,2聚体是可以的。如果是2聚体的话,算一个2聚体的能量就好了,不需要分开算两个分子的单点。如果两个分子一模一样,那么大概率homo和homo-1 是分布在两个分子上面的。

空穴算homo和homo-1,电子算lumo和lumo+1。这个方法不需要加电子

285

帖子

2

威望

2852

eV
积分
3177

Level 5 (御坂)

6#
发表于 Post on 2021-11-7 16:20:38 | 只看该作者 Only view this author
pizaipizai@5989 发表于 2021-10-25 19:31
老哥,我读了你贴的原文献,看你那意思是说把N聚体的结构扒成一个结构文件,然后一次计算一下单点,最后再m ...

手撕是什么专业词汇吗?

8

帖子

0

威望

85

eV
积分
93

Level 2 能力者

7#
发表于 Post on 2021-11-15 17:13:18 | 只看该作者 Only view this author
C:\Users\Muyakui\Desktop
你好,我读了一下这个公式的部分,这里的δq1 和 δq2应该是对应轨道上的donor和acceptor的电荷差值(charges difference),楼主这里直接用分子的轨道占比相减,轨道差分和电荷差分应该是不对等的吧,盼告知@sobereva sob老师如果有时间也请帮忙看一下,谢谢

FCD.png (64.29 KB, 下载次数 Times of downloads: 28)

FCD.png

55

帖子

1

威望

1551

eV
积分
1626

Level 5 (御坂)

8#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-11-19 23:44:46 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Puying 于 2021-11-19 23:48 编辑
虎王 发表于 2021-11-7 16:20
手撕是什么专业词汇吗?

没有没有,我自己瞎叫的。手撕比较形象,就是自己拿手算。

137

帖子

0

威望

3124

eV
积分
3261

Level 5 (御坂)

9#
发表于 Post on 2022-7-22 16:11:51 | 只看该作者 Only view this author
我最近正好也需要算这个积分,对着帖子和原文手撕了一下,觉得△q12好像应该是sqrt(97.10%*2.81%)+sqrt(2.90%*97.19%)=0.33307

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-24 08:34 , Processed in 0.279449 second(s), 25 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list