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[分子对接] 求助:关于受体蛋白的选择

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各位老师好,我想问一下,在选择受体时,需要考虑受体是与激活剂结合或者拮抗剂结合的吗?还是选择拥有与配体结构相似的共晶化合物的受体?还是说这些其实没有那么重要,得分,清晰度,受体蛋白的完整性会更重要呢?

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2#
发表于 Post on 2022-8-2 21:10:24 | 只看该作者 Only view this author
这不取决与你做对接的目的吗?你如果只是为拿到特定配体与受体的复合结构,你就尽量找和你特定配体”结构相似共晶化合物的受体“。如果该结构有缺失,只要不在配体可能的结合位置,都可以用同源建模的方式将其补全,不影响你做对接。

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