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[GROMACS] GROMACS将小分子牵引过细胞膜出现牵引方向相反的问题

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请假一下各位朋友,我想使用GROAMCS 牵引将小分子牵引过细胞膜,但是一直出现牵引方向相反的问题,尝试过将rate改为负数,还是实现不了,想请教一下在不改变系统大小的情况下可以怎样处理,谢谢!

2022-08-26 10-49-27屏幕截图.png (45.4 KB, 下载次数 Times of downloads: 2)

2022-08-26 10-49-27屏幕截图.png

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2#
发表于 Post on 2022-8-26 13:54:21 | 只看该作者 Only view this author
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并清楚、准确反映出帖子具体内容,避免有任何歧义,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “GROMACS 、小分子过膜” 改了,以后务必注意

mdp不完整
如果用了消除整体平动的设置,先关了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-8-26 20:12:05 | 只看该作者 Only view this author
收到,后面注意,我去除了部分组的平动,我先删除试试,谢谢老师。

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