Multiwfn轨道分析结果与VMD图中红色蓝色部分的联系

lei234 · 发表于 Post on 2016-5-10 11:58:40

用Multiwfn分析轨道组成，操作8，1，最后会得到Composition of each atom,该结构中贡献最大的四个原子如图1所示，用VMD得到的图形如图2所示，似乎图1中贡献最大的4个原子是图2中蓝色部分，这两者之间有什么联系吗？用Multiwfn得到的轨道组成信息和VMD中作出的图如何对应起来呢？红色部分和蓝色部分除了代表正相位和负相位之外，有什么化学意义吗？
@sobereva

杨小狗 · 发表于 Post on 2016-5-11 09:14:19

请问您关于原子所占组分的计算的具体步骤或者manual上的哪里？这个问题我也很关注谢谢

lei234 · 发表于 Post on 2016-5-11 11:59:06

杨小狗发表于 2016-5-11 09:14
请问您关于原子所占组分的计算的具体步骤或者manual上的哪里？这个问题我也很关注谢谢

没读懂你的问题。。。

liyuanhe211 · 发表于 Post on 2016-5-11 12:03:28

你这画的是分子轨道的两个相位？不大信呢，哪有分子轨道像这样的。

lei234 · 发表于 Post on 2016-5-13 08:02:57

liyuanhe211 发表于 2016-5-11 12:03
你这画的是分子轨道的两个相位？不大信呢，哪有分子轨道像这样的。

可确实画出来是这样的呀，是按照帖子里的教程画的，您觉得哪里有问题呢？是红色和蓝色在不同的原子上吗？其它也有类似的情况，我不知道该怎么分析了，还请赐教~~

sobereva · 发表于 Post on 2016-5-14 18:22:41

lei234 发表于 2016-5-13 08:02
可确实画出来是这样的呀，是按照帖子里的教程画的，您觉得哪里有问题呢？是红色和蓝色在不同的原子上吗？ ...

你用Multiwfn主功能0来把那个轨道画出来，截个图我看一下

sobereva · 发表于 Post on 2016-5-14 18:23:56

杨小狗发表于 2016-5-11 09:14
请问您关于原子所占组分的计算的具体步骤或者manual上的哪里？这个问题我也很关注谢谢

手册4.8节有大量的例子，也可以看
谈谈轨道成份的计算方法
http://sobereva.com/131

lei234 · 发表于 Post on 2016-5-15 01:59:24

sobereva 发表于 2016-5-14 18:22
你用Multiwfn主功能0来把那个轨道画出来，截个图我看一下

找到问题了，是我在画图的时候没有把两个Isosurface选到同一个轨道，一个Isosurface选的是HOMO轨道的，一个Isosurface选的是LUMO轨道的。。。

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