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[GROMACS] charmm力场生成问题

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楼主
老师好。我在https://cgenff.paramchem.org生成str后,使用cgenff_charmm2gmx报错,可能是由于我是python3的原因,因此使用cgenff_charmm2gmx_py3_nx2.py转化报错为

WARNING: CGenFF versions are not equivalent!


NOTE 4: To avoid duplicated parameters, do NOT select the 'Include parameters that are already in CGenFF' option when uploading a molecule into CGenFF.
Error in atomgroup.py: read_mol2_coor_only: no. of atoms in mol2 (11) and top (0) are unequal
Usually this means the specified residue name does not match between str and mol2 files


CGenFF 版本又不一致,如何知道自己使用的版本和在线网站生成时的版本。该如何下载在线生成的版本呢

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2#
发表于 Post on 2022-10-9 19:53:30 | 只看该作者 Only view this author
请问楼主,您的问题解决了吗?我也遇到了同样的问题

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