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[Gaussian/gview] 用6-31G(d,p)和6-311G(d,p)做TDDFT计算,耗时差异巨大

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楼主
老师好,我在用Gaussian做TDDFT计算的时候用的是B3LYP-D3/6-311G(d,p)算了20个states, 算了24个小时都没有结束。然后我试着把基组换成B3LYP-D3/6-31G(d,p)其他参数不变,1h20min就结束了。我想请问:
1. 在用Gaussian做TDDFT计算的时候,为何6-31G(d,p)和6-311G(d,p)耗时的差异如此之大。因为我之前对比过他们在做opt freq的时候,6-311G(d,p)是比6-31G(d,p)用时要多,但没有多出这么多;
2. 我看到Sob老师有讲过,计算TDDFT的时候,6-311G*对比6-31G*提升其实比较有限。因为我在做opt freq的时候是用的B3LYP-D3/6-311G(d,p),如果这里用B3LYP-D3/6-31G(d,p)做TDDFT是否合理,到时候审稿人会不会有意见。
谢谢!

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发表于 Post on 2022-10-15 17:15:24 | 只看该作者 Only view this author
监控输出文件,弄清楚davidson迭代都做了多少轮,不会判断就把输出文件压缩后上传
没有体系特征没法告诉你是否有必要用6-311G**,体系大小都不明确。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-15 17:32:01 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-10-15 17:15
监控输出文件,弄清楚davidson迭代都做了多少轮,不会判断就把输出文件压缩后上传
没有体系特征没法告诉你 ...

谢谢老师!中性有机分子,总共100个原子,含有C,H,S元素。使用6-311g(d,p)计算的已经迭代了39轮,还没有一个state converge。而使用6-31g(d,p)计算的迭代了9轮,所有的states就converge 了。

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发表于 Post on 2022-10-15 17:40:00 | 只看该作者 Only view this author
B3LYP-D3/6-311G(d,p)的计算是卡在了SCF步骤还是TDDFT步骤?如果是卡在了TDDFT,是因为每步TDDFT迭代时间变长了还是总迭代次数变多了?
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-15 18:30:21 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-10-15 17:40
B3LYP-D3/6-311G(d,p)的计算是卡在了SCF步骤还是TDDFT步骤?如果是卡在了TDDFT,是因为每步TDDFT迭代时间变 ...

SCF很快就结束了,卡在了TDDFT, 总的迭代次数变多了。

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发表于 Post on 2022-10-15 18:51:24 | 只看该作者 Only view this author
zhangzb 发表于 2022-10-15 10:32
谢谢老师!中性有机分子,总共100个原子,含有C,H,S元素。使用6-311g(d,p)计算的已经迭代了39轮,还没有 ...

是不是给的内存太少了?如果内存刚好够6-31G(d,p)的计算但是不够6-311G(d,p)的计算,那么程序就会限制Davidson方法的展开空间的维度来节省内存,导致收敛变慢
Zikuan Wang
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-15 19:10:02 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 zhangzb 于 2022-10-15 19:17 编辑
wzkchem5 发表于 2022-10-15 18:51
是不是给的内存太少了?如果内存刚好够6-31G(d,p)的计算但是不够6-311G(d,p)的计算,那么程序就会限制Dav ...

6-31G(d,p)和6-311G(d,p)用的是同一台服务器,设置相同,都是%nprocshared=16,%mem=128GB,因为这台服务器只有16个核心。现在使用6-311G(d,p)计算的还在迭代,但依然没有看到有state converge。
我用另外一台服务器计算相同的分子,也用6-311G(d,p),设置成%nprocshared=32,%mem=128GB,现在经过3h20min迭代到29轮的时候,可以看到有2个states converge.
PS:这两台服务器的单核性能差不多。我下次可以把内存加大些。谢谢您!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-17 11:09:02 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-10-15 18:51
是不是给的内存太少了?如果内存刚好够6-31G(d,p)的计算但是不够6-311G(d,p)的计算,那么程序就会限制Dav ...

老师您好!我按照您的建议把内存增加到512GB, %nprocshared=16,%mem=512GB,结果还是一样,16h之后还在迭代,没有一个state收敛。
然后我按照Sob老师的方法(http://sobereva.com/348)用6-311G(d,p), %nprocshared=16,%mem=128GB进行分批计算看看他们耗时是怎么样的。先计算states(1~5), 用时1h23min结束。接着算states(6~10), 1h28min结束。后面的states(11~15)正在进行中。

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