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计算化学公社»论坛首页 › 理论与计算化学 (Theoretical and Computational Chemistry) › 分子模拟 (Molecular Modeling) › 求助spce水分子团簇截断半径设置
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[Lammps] 求助spce水分子团簇截断半径设置

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whyu

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发表于 Post on 2024-12-30 10:09:01 | 只看该作者 Only view this author |只看大图 View big picture 回帖奖励 |倒序浏览 Reverse view |阅读模式 Reading model
lammps模拟体系：spce水模型、40*40*40的盒子、  pair_style lj/cut/coul/long 10.0、  lattice sc 3.104   、设置的密度为1、
1、想要求该纯水体系中的水分子团簇，类似于下图中
compute cluster/atom 然后dump输出每个原子的cluster id，再用脚本进行处理。这种方法可行吗？

2、compute cluster/atom 该命令中截断半径应该设置多少合适？
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