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[综合交流] 磺化二硫化钼如何生成cif文件用于cp2k结构优化

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  各位老师好,我合成了一个新物质磺化二硫化钼,其晶体结构如图一所示。随后我想生成cif文件进行cp2k的结构优化计算,但是二硫化钼接枝后不能生成cif文件,如图二所示。随后我直接用mol2文件在Multiwfn中产生cp2k的inp文件,根据https://zhuanlan.zhihu.com/p/710148823这篇的操作产生的inp文件,inp文件在文件中上传。但是计算接着就停止了,上传了out文件。我是新手也不知道该如何解决,请各位老师赐教,谢谢老师!

屏幕截图 2024-08-26 112359.jpg (47.52 KB, 下载次数 Times of downloads: 7)

磺化二硫化钼结构图

磺化二硫化钼结构图

屏幕截图 2024-08-26 112430.jpg (57.52 KB, 下载次数 Times of downloads: 7)

不能产生cif文件图

不能产生cif文件图

MS.inp

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MS.out

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发表于 Post on 2024-8-26 11:37:45 | 只看该作者 Only view this author
cif记录的是三维晶体,当前是二维周期性的,你得转化成三维的才行
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-8-26 11:41:01 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-8-26 11:37
cif记录的是三维晶体,当前是二维周期性的,你得转化成三维的才行

好的,谢谢老师

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