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[ORCA] orca 5如何方便的冻结原子

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各位老师大家好:
      我用orca优化一个460原子的体系,头150个原子需要冻结,有什么方便的办法吗?我的版本是 orca_5_0_1

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发表于 Post on 2022-10-18 16:03:40 | 只看该作者 Only view this author
写个脚本循环输出各个冻结原子的命令

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发表于 Post on 2022-10-18 16:27:08 | 只看该作者 Only view this author
用下文的功能创建输入文件,直接就能输入序号设置哪些原子被冻结,极为方便
详谈Multiwfn产生ORCA量子化学程序的输入文件的功能
http://sobereva.com/490http://bbs.keinsci.com/thread-13560-1-1.html

任务选择几何优化,然后选-3,直接提示输入被冻结的原子序号




北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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黄昏粼粼

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发表于 Post on 2022-10-18 21:27:33 | 只看该作者 Only view this author
比如这样
%geom Constraints
{ C N1 C }
end
end
通过改变输入内容可以达到不同效果
Constraining bond distances : { B N1 N2 value C }
Constraining bond angles : { A N1 N2 N1 value C }
Constraining dihedral angles : { D N1 N2 N3 N4 value C }
Constraining cartesian coordinates : { C N1 C }
摘自5.0.1手册,还有一些其他的用法,你可以自己去看看手册
桃李春风一杯酒,江湖夜雨十年灯

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-23 15:08:29 | 只看该作者 Only view this author
pikachuupup 发表于 2022-10-18 21:27
比如这样
%geom Constraints
{ C N1 C }

非常感谢您

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-23 15:09:27 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-10-18 16:27
用下文的功能创建输入文件,直接就能输入序号设置哪些原子被冻结,极为方便
详谈Multiwfn产生ORCA量子化学 ...

非常感谢sob老师,发文章的时候一定引用您的文章和软件

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发表于 Post on 2024-12-26 10:11:00 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-10-18 16:27
用下文的功能创建输入文件,直接就能输入序号设置哪些原子被冻结,极为方便
详谈Multiwfn产生ORCA量子化学 ...

sorb老师想问一下,我想冻结134-532,666-2660,我按照这个方法去产生inp文件发现133-531,665-2659冻结了,我是不是在冻结的时候应该都加1去冻结?

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发表于 Post on 2024-12-26 23:50:05 | 只看该作者 Only view this author
Huyang 发表于 2024-12-26 10:11
sorb老师想问一下,我想冻结134-532,666-2660,我按照这个方法去产生inp文件发现133-531,665-2659冻结了 ...

是。Multiwfn里序号始终从1开始计,ORCA从0开始计
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发表于 Post on 2025-12-20 16:07:03 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-10-18 16:27
用下文的功能创建输入文件,直接就能输入序号设置哪些原子被冻结,极为方便
详谈Multiwfn产生ORCA量子化学 ...

你好,我下载的Multiwfn_3.8_dev版本,想生成固定原子的orca输入文件,但是没有-3这个选项

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发表于 Post on 2025-12-21 05:20:26 | 只看该作者 Only view this author
GYF12 发表于 2025-12-20 16:07
你好,我下载的Multiwfn_3.8_dev版本,想生成固定原子的orca输入文件,但是没有-3这个选项

先把任务类型选成几何优化
认真看Multiwfn下载页面的提示

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2025-12-22 10:57:07 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-12-21 05:20
先把任务类型选成几何优化
认真看Multiwfn下载页面的提示

好的,谢谢老师!

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