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[新手求助] 关于聚合物热裂解反应自由能变随温度变化的求助

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各位老师,请教一个问题。
我想做一个关于聚合物热解反应的自由能变,随温度变化的计算。看了sob老师的帖子《使用Shermo结合量子化学程序方便地计算分子的各种热力学数据》后还有一点疑问,对于像聚合物这类体系,是否应该看作柔性体系,考虑其热力学量的构象平均?

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发表于 Post on 2024-2-26 22:34:23 | 只看该作者 Only view this author
对,除非是共轭聚合物,否则一般是柔性的。
相比构象平均而言,更重要的是要考虑环境效应,也就是聚合物分子旁边的聚合物链对聚合物分子的影响。也就是一般来说只考虑一条聚合物链是不太可靠的,最少也得用隐式溶剂模型,把旁边的聚合物链近似看作一种溶剂去考虑
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-2-28 14:20:44 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-2-26 22:34
对,除非是共轭聚合物,否则一般是柔性的。
相比构象平均而言,更重要的是要考虑环境效应,也就是聚合物分 ...

感谢老师的回答,但是对此我还有一点点问题:
由于我需要计算的聚合物体系脂肪族聚酯酰胺(包含酰胺键和酯键脂肪族聚合物),他们之间存在氢键相互作用,而隐式溶剂模型对于氢键相互作用的描述并不好。那么对于这类情况,又该如何考虑其环境效应呢。

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发表于 Post on 2024-2-28 17:24:45 | 只看该作者 Only view this author
ursamajor 发表于 2024-2-28 07:20
感谢老师的回答,但是对此我还有一点点问题:
由于我需要计算的聚合物体系脂肪族聚酯酰胺(包含酰胺键和 ...

你从哪看的“隐式溶剂模型对于氢键相互作用的描述并不好”?
那是说隐式溶剂模型对于溶质和溶剂形成很强的氢键,且溶剂分子没有显式画出来的情况,描述不好。“强”和“两个分子其中一个是溶剂分子”两个条件缺一不可
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-2-28 18:20:25 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-2-28 17:24
你从哪看的“隐式溶剂模型对于氢键相互作用的描述并不好”?
那是说隐式溶剂模型对于溶质和溶剂形成很强 ...

我在看了《谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算》说的“隐式溶剂模型的缺点是无法表现溶剂与溶质之间的强相互作用,如氢键。”过后理解错了,感谢老师对我理解上的错误的指正,我的疑惑都解决了,感谢

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