处理非标准残基生成rtp文件之后，在力场文件下添加了hdb与rtp文件，但pdb2gmx出错

dimoo

以下是报错的具体信息：
Fatal error:
Residue 8 named ARG of a molecule in the input file was mapped
to an entry in the topology database, but the atom - used in
that entry is not found in the input file. Perhaps your atom
and/or residue naming needs to be fixed.

For more information and tips for troubleshooting, please check the GROMACS
website at http://www.gromacs.org/Documentation/Errors
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我仔细检查了pdb和rtp文件，并未发现有原子名称错误的问题。以下是涉及到的初始小肽的pdb文件和处理之后的非标准残基的rtp文件
恳请各位指导!

sobereva

如果你就只用这个rtp，肯定不行，其它的残基都没定义。要上传就上传实际用的完整的rtp。当前也没提示是你非标准残基的问题

dimoo

sob老师您好，感谢您的回复。我是把该残基的rtp文件移动到了力场文件夹下面，力场文件里不是已经定义了其他的残基了吗？