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[新手求助] 高斯优化结构过程中遇到问题:Error termination in NtrErr: NtrErr Called from ...

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大家好,我在用高斯软件优化构象时候,计算中出现: Error termination in NtrErr: NtrErr Called from FileIO.导致计算中断。重复了多次都是这样,求助各位大佬走过路过帮忙看看。PS:这个优化任务计算过程要花费4-5个小时,怎样调整来减少计算时间?这样算个几次就到了组会时间了。





202206021127548821..png (20.02 KB, 下载次数 Times of downloads: 28)

202206021127548821..png

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发表于 Post on 2022-6-2 14:28:41 | 只看该作者 Only view this author
可能原因很多,诸如程序bug、安装有问题、硬盘空间不够等,反复测试找原因

当前纯粹瞎算,DFT-D都不知道加,好好看
谈谈“计算时是否需要加DFT-D3色散校正?”
http://sobereva.com/413http://bbs.keinsci.com/thread-9772-1-1.html
谈谈量子化学研究中什么时候用B3LYP泛函优化几何结构是适当的
http://sobereva.com/557http://bbs.keinsci.com/thread-17899-1-1.html

带上DFT-D3,给磷酸基的氧原子改成6-31+G*,带上隐式溶剂模型(如果在溶剂环境下),接着之前最后一帧继续算
除非用PM6-D3或PM7半经验方法(假设你只会用Gaussian),否则时间没法进一步显著节约
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-6 16:09:42 | 只看该作者 Only view this author
Sob老师您好,非常感谢您的指导!我将关键词改为:
# opt B3LYP-D3(BJ)/6-31+G* scrf(iefpcm,solvent=Water)
再次计算出现了新的问题:
# opt B3LYP-D3(BJ)/6-31+G* scrf(iefpcm,solvent=Water)
-----------------------------------------------------
QPErr --- A syntax error was detected in the input line.
# opt B3LYP-D3(BJ)/6-31+G* scrf(iefpcm,s
             '
Last state= "GCL"
TCursr=      3523 LCursr=        12
Error termination via Lnk1e in /public1/home/scb8429/software-scb8429/g09/l1.exe at Mon Jun  6 16:02:48 2022.
Job cpu time:       0 days  0 hours  0 minutes  0.0 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=      5 Int=      0 D2E=      0 Chk=      1 Scr=      1
计算很快就停止了。这是什么原因导致的呢

initial_2.zip

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天上地下三山亖海五湖六合八荒九州之泛粤大典編輯委員會編外委員

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发表于 Post on 2022-6-6 16:24:33 | 只看该作者 Only view this author
# opt B3LYP/6-31+G* scrf=iefpcm em=gd3bj
ORCA大法好!CP2K大法好!
嶺南粤音 泛粤典 https://jyutjam.org/

山河自落蒼梧月,風雨猶驅草木兵。
san huɔɞ ki lɔk tʰɔŋ ŋ ᵑgut,fʊŋ ʝi ʝiu kʰui tʰɔu ᵐbʊk pɪŋ

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-10 11:54:28 | 只看该作者 Only view this author
已经成功计算完成,感谢两位老师!

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