计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 704|回复 Reply: 3
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[综合交流] 富勒烯(LuNC@C76)结构优化结果与实际单晶结构相差较大求助

[复制链接 Copy URL]

4

帖子

0

威望

23

eV
积分
27

Level 2 能力者

小白一枚,最近在进行LuCN@C76的结构优化时,计算的碳笼中的LuNC团簇结构与实际单晶测出的团簇角度相差较大,差了有10~20°左右。
泛函:PBE1PBE,B3LYP,C和N原子用的基组分别有6-31G*,def2-SVP和def2-TZVP,金属Lu一直使用的SDD赝势(大核版本),计算用的g16。在上面各种泛函和基组的组合下,最后优化出的碳笼中的LuNC团簇结构与实际单晶测出的团簇角度相差较大。目前有两个问题想请教一下各位大佬:
1、不知道我选择的泛函和基组是否合适?是否有其他泛函和基组推荐?或者换成g09?可能可以优化的结构更接近单晶的结果。
2、如果最后实在优化不好,是否可以直接采用晶体结构进行单点计算,分析LUMO-HOMO和静电势等?如果可以,应该采用什么泛函和基组好一些呢?
晶体结构如图所示,求大神指点迷津,万分感谢。


LuCN@C76晶体结构.JPG (171.55 KB, 下载次数 Times of downloads: 8)

LuCN@C76晶体结构.JPG

1万

帖子

0

威望

7393

eV
积分
18146

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2023-5-3 15:34:58 | 只看该作者 Only view this author
可以改用小核赝势,或者做全电子相对论计算试试,毕竟你只有一个Lu,计算量增加不大;此外可以考虑改用范围分离泛函,因为你有大共轭体系,可能有SIE的影响
没有任何理由改用G09
这个分子用晶体结构问题不大,因为不存在容易受晶体堆积力影响的基团,也不存在氢原子等XRD解不出来或解不准的原子。但假如实验晶体有无序,那就要慎用了
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

4

帖子

0

威望

23

eV
积分
27

Level 2 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-5-4 00:31:13 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-5-3 15:34
可以改用小核赝势,或者做全电子相对论计算试试,毕竟你只有一个Lu,计算量增加不大;此外可以考虑改用范围 ...

好的,好的,我试一下,感谢老师的指导和帮助。

312

帖子

2

威望

2300

eV
积分
2652

Level 5 (御坂)

4#
发表于 Post on 2023-5-4 14:18:40 | 只看该作者 Only view this author
这个富勒烯没有别人算过嘛,一个新的富勒烯合成不久之后就会有计算组的人算,如果是早以前合成的,那么找找人家的坐标不就行了

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-24 00:21 , Processed in 0.215992 second(s), 30 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list