MS中添加真空层slab与直接建立一个大的box将分子放在中间有没有差别

dark_cosmos · 发表于 Post on 2016-5-28 12:44:07

MS中添加真空层slab与直接建立一个大的box将分子放在中间有没有差别？
MS中对于slab添加之后，对于库仑力求和放的Ewald来说，有没有考虑极化力矩的修正，如果没有那么加slab的大小是不是只能一直增加到结果变化可以忽略为止？

sobereva · 发表于 Post on 2016-5-28 17:48:01

不明白你要算什么问题。
分子放盒子中间是孤立体系，牵扯到slab体系就是一/二维周期性体系，体系都不同没有可比性。

dark_cosmos · 发表于 Post on 2016-5-29 13:39:12

sobereva 发表于 2016-5-28 17:48
不明白你要算什么问题。
分子放盒子中间是孤立体系，牵扯到slab体系就是一/二维周期性体系，体系都不同没 ...

谢谢sob老师回复!是这样的我是要建立一个一维周期性体系（我看了下，自己确实没有表述清楚啊），其实我想问的就是加slab这个命令与直接在盒子周围留下一些真空区域是不是等效的，在MS中slab有没有什么额外的关联的算法。

sobereva · 发表于 Post on 2016-5-29 20:41:30

dark_cosmos 发表于 2016-5-29 13:39
谢谢sob老师回复!是这样的我是要建立一个一维周期性体系（我看了下，自己确实没有表述清楚啊），其实我想 ...

加slab命令我记不太清楚了，反正你就看最后加完的结果，如果加了之后和你自己往周围留下真空区最后盒子大小、形状是相同的，那么实际计算的时候也是等价的。

dark_cosmos · 发表于 Post on 2016-5-29 21:08:06

sobereva 发表于 2016-5-29 20:41
加slab命令我记不太清楚了，反正你就看最后加完的结果，如果加了之后和你自己往周围留下真空区最后盒子大 ...

好的额，多谢sob老师！

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