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[新手求助] Gaussian用oniom法计算如何设置电荷和多重度?

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本帖最后由 Tanya 于 2022-11-29 12:25 编辑

大家好!先说一下背景情况。我主业是有机化学,平时一般用Gaussian算算有机化学催化反应机理,这次有个同事让帮忙计算簇合物的荧光,第一次接触这种体系,准备参照社长的博文(http://sobereva.com/314)进行研究。     同事提供了晶体结构的cif文件,体系中含有溶剂,直接在g16下优化结构,溶剂就跑散了。尝试着用GaussView将晶胞扩大为3*3*3的超晶胞,然后把外围的金属原子都删除,只留下与中心配合物有可能有作用的结构片段,并且给不完整的片段加上氢补全结构。因为体系太大,原子总数达到了500左右,根本算不动。为了降低计算量,采用了oniom法,将外层原子都冻住用PM6的低水平,内层结构(含溶剂)作为高水平用PBE1-GD3BJ/def2SVP水平下进行结构优化,由于外层有个笼子,溶剂没有跑散,优化的结果比较接近晶体测试的结果。然后我再把外层删除,在Cam-B3LYP-GD3BJ/def2TZVP TD水平下计算了S0-S10。
    下面要问的问题来了,计算T1的时候,需要将内层结构的电荷和多重态设置为0 3再进行结构优化。看了下gaussian说明书里面,第一对是real-low,第二对是molel-high,第三对是model-low;按照这个理解应该设置为0 1 0 3 0 3,但是优化的时候总是SCF不收敛,有次输错了,弄成了03 03 01,反而收敛算完了。把我完全搞糊涂了。我这种情况下,电荷和多重度该如何设定才正确?另外,我这样计算合理吗?
先谢谢了!



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发表于 Post on 2022-11-30 09:27:10 | 只看该作者 Only view this author
没有叫PBE1的泛函
PM6应当改成PM6D3或者PM7

净电荷和自旋多重度设置没问题。不收敛就照常解决就完了
解决SCF不收敛问题的方法
http://sobereva.com/61
错误的计算即便正常完成了也毫无意义


注意,用半经验方法描述low层,并没法直接体现出环境效应对中心分子吸收光谱的影响,影响的仅有势能面层面。low层用恰当的原子电荷,结合电子嵌入,才能体现这种效果。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-30 12:29:51 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-11-30 09:27
没有叫PBE1的泛函
PM6应当改成PM6D3或者PM7

谢谢卢老师的指导。泛函应该是PBE0

我把外层改成PM7继续计算。

另外,尝试学习cp2k,刚刚编译好cp2k,用它来计算晶体这种周期性体系的荧光是不是更合理?

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发表于 Post on 2022-12-1 04:03:11 | 只看该作者 Only view this author
Tanya 发表于 2022-11-30 12:29
谢谢卢老师的指导。泛函应该是PBE0

我把外层改成PM7继续计算。

没有绝对的可比性
不是所有晶体体系用CP2K相对于量化程序用簇模型都是更好的选择
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