利用Gaussian计算氨基酸静电势极值点时，是否需要考虑其两性离子结构

renrenren

想请教大家一下。我想要利用静电势法来筛选共晶配体。所以需要利用Gaussian来计算其静电势获得静电势极值点然后筛选。但是对于氨基酸来说，我不知道是否应该要考虑其两性离子结构。在合成共晶时可以利用溶剂辅助，也可以不用任何溶剂。我已经尝试考虑其两性离子结构--加上了溶剂化才可以顺利进行计算，也尝试了只把他们视作中性结构。两种结果差距实在很大。所以，想要请教大家建议，麻烦了！

wzkchem5

在共晶里这个氨基酸是两性离子的话，就用两性离子，否则不用。
如果不确定共晶里氨基酸的存在形式，那就先去确定

sobereva

Gaussian并没有计算静电势极值点的能力，必须靠Multiwfn才行，看

获得分子表面极值点：
使用Multiwfn的定量分子表面分析功能预测反应位点、分析分子间相互作用
http://sobereva.com/159
使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图（含视频演示）
http://sobereva.com/443（http://bbs.keinsci.com/thread-11080-1-1.html）
使用Multiwfn结合VMD分析和绘制分子表面静电势分布
http://sobereva.com/196

获得全局极小点：
使用Multiwfn对静电势和范德华势做拓扑分析精确得到极小点位置和数值
http://sobereva.com/645（http://bbs.keinsci.com/thread-30769-1-1.html）
绘制静电势全局极小点+等值面图展现孤对电子位置的方法
http://sobereva.com/493（http://bbs.keinsci.com/thread-13638-1-1.html）

renrenren

sobereva 发表于 2022-12-18 18:45
Gaussian并没有计算静电势极值点的能力，必须靠Multiwfn才行，看

获得分子表面极值点：

是的，我是结合了Multiwfn得到静电势极值点。非常感谢sob老师的解答！我会仔细研究的。

renrenren

wzkchem5 发表于 2022-12-18 18:32
在共晶里这个氨基酸是两性离子的话，就用两性离子，否则不用。
如果不确定共晶里氨基酸的存在形式，那就先 ...

好的！多谢解答