计算系间窜跃速率的软件问题

zqq19930303 · 发表于 Post on 2022-11-13 10:10:54

我想问一下，要想计算系间窜跃速率和反系间窜跃速率以及非辐射速率，除了用momap软件外还有别的软件可以计算吗

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-11-13 15:29:23

ISC、RISC可以用orca算，将来（过一年左右？）orca会支持IC

zqq19930303 · 发表于 Post on 2022-11-13 17:22:15

wzkchem5 发表于 2022-11-13 15:29
ISC、RISC可以用orca算，将来（过一年左右？）orca会支持IC

老师我查手册发现orca计算ISC速率需要首先优化S1和T1态，得到.hess文件。我的S1和T1态的构型已经用高斯优化完了，能用高斯优化后的结果，再用orca计算ISC吗？那个.hess文件和高斯中的fchk是一回事吗

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-11-13 21:29:11

zqq19930303 发表于 2022-11-13 10:22
老师我查手册发现orca计算ISC速率需要首先优化S1和T1态，得到.hess文件。我的S1和T1态的构型已经用高斯 ...

hess和fchk是毫无关系的两个文件格式。
原则上如果你能写一个脚本把fchk里的Hessian转成hess文件的格式，那就可以不用重算频率。但是估计没有这种现成的脚本，新写一个还不如重算一遍频率更方便。又因为结构优化和频率所用软件必须严格一致，所以结构优化也需要用orca重新优化，但是因为可以用高斯优化的结构做初猜，所以结构优化很快就能收敛

smooth85 · 发表于 Post on 2022-11-16 11:04:06

zqq19930303 发表于 2022-11-13 17:22
老师我查手册发现orca计算ISC速率需要首先优化S1和T1态，得到.hess文件。我的S1和T1态的构型已经用高斯 ...

根据Marcus公式，有了S1和T1的结构和能量，很容易得到对应的参数，delta_G, 重组能 lamda，再利用ORCA算个SOC 就可以算速率了

风起~ · 发表于 Post on 2022-11-16 11:09:48

zqq19930303 发表于 2022-11-13 17:22
老师我查手册发现orca计算ISC速率需要首先优化S1和T1态，得到.hess文件。我的S1和T1态的构型已经用高斯 ...

论坛好像有个脚本可以转换到orca的.hess文件你找一下

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-11-16 15:10:54

smooth85 发表于 2022-11-16 04:04
根据Marcus公式，有了S1和T1的结构和能量，很容易得到对应的参数，delta_G, 重组能 lamda，再利用ORCA算 ...

这个是粗糙的计算方法。既然楼主考虑的是MOMAP的替代品（而MOMAP是用TVCF方法计算的），那估计Marcus理论的精度对于楼主来说不够，这种情况下一个比较好的选项就是orca的ESD模块，和MOMAP的计算原理大同小异，原则上精度比Marcus理论高

smooth85 · 发表于 Post on 2022-11-18 12:01:04

wzkchem5 发表于 2022-11-16 15:10
这个是粗糙的计算方法。既然楼主考虑的是MOMAP的替代品（而MOMAP是用TVCF方法计算的），那估计Marcus理论 ...

学习了

tiantian365 · 发表于 Post on 2022-12-22 13:51:28

MOMAP一言难尽，搞了这么多年基本原地踏步，还是收费的，嗨！

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[综合交流] 计算系间窜跃速率的软件问题

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