使用OT来优化遇到KS energy is an abnormal Value (Nan/Inf)的问题

qqppoqq · 发表于 Post on 2023-1-10 11:50:56

老师们好，

   我最近使用cp2k来模拟Zn2SnO4体系，使用PBE+DZVP-MOLOPT-SR-GTH+diag体系来优化，老是震荡。
   我于是建立超胞，使得a,b,c晶胞参数大约都相等，于是我使用OT来优化，收到‘KS energy is an abnormal Value (NaN/Inf)’的错误信息，请问一下这是问啥？怎么修改呀？
   先谢谢老师

Zn2SnO4.inp (16.06 KB, 下载次数 Times of downloads: 16)

Zn2SnO4.out (11.34 KB, 下载次数 Times of downloads: 6)

sobereva · 发表于 Post on 2023-1-10 12:37:14

我这里用2023.1 popt版能正常计算
貌似你用的ssmp版，强烈建议改用popt。另外，并行核数建议等于物理核心数，而不要等于总逻辑核心数

你的体系建议用XY周期性结合MT的PSOLVER。另外slab建得太薄。

qqppoqq · 发表于 Post on 2023-1-10 12:56:19

知道了谢谢老师我马上试试我看见那篇帖子使用的CenOS系统，我使用UBUNTU20.04来安装应该没啥区别吧？

sobereva · 发表于 Post on 2023-1-10 13:50:24

qqppoqq 发表于 2023-1-10 12:56
知道了谢谢老师我马上试试我看见那篇帖子使用的CenOS系统，我使用UBUNTU20.04来安装应该没啥区别吧？

我不对Ubuntu的情况做评论
我极其不喜欢Ubuntu

JackHuang · 发表于 Post on 2023-1-14 00:34:53

我遇到的情况:
CP2K 7.1 cp2k.popt在装在不同的机器上同样的项目在自己的电脑6核上可以正常运行，在集群上报错。我以为是我的版本的问题。

于是我重新编译了CP2K 2022版的。最后有生成cp2k.popt，但是一个链接指向了cp2k.psmp。

CP2K 2022 cp2k.psmp 在集群上20个核的节点上运行正常，在40核的节点上运行报错。具体是什么原因尚不清楚。

JackHuang · 发表于 Post on 2023-1-14 00:35:24

我遇到的情况:
CP2K 7.1 cp2k.popt在装在不同的机器上同样的项目在自己的电脑6核上可以正常运行，在集群上报错。我以为是我的版本的问题。

于是我重新编译了CP2K 2022版的。最后有生成cp2k.popt，但是一个链接指向了cp2k.psmp。

CP2K 2022 cp2k.psmp 在集群上20个核的节点上运行正常，在40核的节点上运行报错。具体是什么原因尚不清楚。

LittlePupil · 发表于 Post on 2023-1-14 23:40:50

JackHuang 发表于 2023-1-14 00:34
我遇到的情况:
CP2K 7.1 cp2k.popt在装在不同的机器上同样的项目在自己的电脑6核上可以正常运行，在集群 ...

CP2K对环境极其敏感，你的问题可能是因为两个节点最高支持的指令集一个和编译CP2K的host一样，另一个不一样。

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