本帖最后由 johnshall 于 2023-1-29 11:23 编辑
故事起源于早上的物理化学课，老师要求安装 Gaussian 09 来预测结构数据。当然 Mac 用户是永远得不到关爱的，老师不会给我提供安装包，于是我就在网上探寻一番，发现 Gaussian 09 真的已经太古老了：官方仅仅发行了适用于 MacOS 的 32 位版本。而激进的苹果从 macOS Catalina 开始不再兼容 32 位 App。且网上相关资料较少，我看到了大量求助帖却得不到有效的回复。经过一上午的摸索我终于实现了在 macOS 上优雅的使用 Gaussian 09 与 GaussView 6，在这里记录一下踩坑的路，希望可以帮上各位科研工作者。 首先聊一聊 Gaussian 套件的结构，简单的说是在 GaussView 上作图，然后通过 Gaussian 进行分析运算。最直接粗暴的方法是用 Wine 容器直接安装 Windows 版本的 Gaussian 与 GaussView（我没试过，盲猜性能极低且兼容性很差）。且我这里的结构是：利用 Crossover 容器运行 GaussView 6，导出草图后放入运行在原生 macOS 上的 Gaussian 09 进行运算，实现性能最大化。 先回答几个问题： - 为什么我要用 GaussView 6 的 Windows 版本？
- 答：我能找到的 GaussView 5 的 Mac 版本是 32 位的，并且找不到 GaussView 6 的 Mac 版本；
- 我可以在 Crossover 中运行 GaussView 5 吗？
- 答：经过各种参数的枚举，所有我能找到的 GaussView 5 版本均无法成功的在 Crossover 中安装，当然这个结论不一定对，您可以自行安装测试；
- Gaussian 09 需要破解吗？
- 答：不需要，但是 GaussView 需要提供一个序列号。
那么，背景铺设完毕，跟着我一起来吧！ 1. 材料准备- macOS Catalina 以上版本（如果是 Inter 芯片将获得更佳性能，Apple 芯片则需要 Rosetta 2 转译）
- Gaussian 09M 下载 Mac 文件夹下的 G09M.zip
- GaussView 6 下载 Windows 文件夹下的 [url=]GV6.0.16_win64.exe，记住文件夹下文本文件提供的序列号[/url]
- 需要一些命令基础和反复阅读的双眼
2. 安装 Gaussian 09- 解压 G09M.zip 将获得的 gaussian09 文件夹拖入“应用程序”文件夹下（/Users/你的用户名/Applications）;
- 按住 command + 空格 输入 terminal 打开终端（# 后内容为注释，不用输入）；
- 设定权限
- 输入命令 chmod 750 ~/Applications/gaussian09
- 设定环境变量
- 输入命令 vim ~/.zshrc # macOS Catalina 及以上版本默认终端应该都是 zsh
- 确保在英文输入模式下，
- 按 G # 跳转到末尾
- 按 shift + 4 # 跳转到行尾
- 按 a # 进入编辑模式
- 按回车
- 输入 export g09root=/Applications/gaussian09/ # 然后按回车
- 输入 export GAUSS_SCRDIR=/Applications/gaussian09/Scratch # 这句命令是配置临时文件夹，然后按回车
- 输入 source $g09root/g09/bsd/g09.profile
- 按 esc 键
- 按 : 键
- 输入 wq
- 按回车
- 关闭终端，在 dock 栏右击 terminal 图标，点退出，确认下方圆点消失
- 至此，Gaussian 09 安装完毕
2. 安装 GaussView 6- 安装 Crossover（这个就各显神通了，我个人安装的是 Crossover 21.2 ，打开需要魔法）；
- 打开 Crossover，选择 安装 Windows 程序；
- 点击左下角，查看所有应用程序；
- 选择 科学，技术与数学 --> 生物与化学 --> Palynodata （没有为什么，因为这是试出来的，可以完美运行），点击继续；
- 选择安装包 --> 下载安装程序 --> 选择之前下载的 [url=]GV6.0.16_win64.exe，点击继续；[/url]
- 容器使用“新 Windows 10 64-bit 容器”，右边取个名字，然后按继续，就像 Windows 那样安装，记得设桌面图标与文件后缀关联；
- 安装需要序列号，可以在之前百度云中文本文件找到；
- 打开运行吧！
3. 协同 Gaussian 09 与 GaussView 6- 在 GaussView 6 中绘图，保存到 C 盘下；
- 打开 Crossover 主程序，选择右边的容器，右击，“打开 C: 盘”，
- 把文件拷贝到任意文件夹下，例如“文档”文件夹（这里按照“文档”文件夹做演示，其他文件夹改目录即可）；
- 右击文件，用任意文本编辑器打开，将第一行的 %chk=C:\你的文件名.chk 改为 %chk=你的文件名.chk ，或者直接留空
- 打开终端，输入 cd ~/Documents/
- 按照需要的方法在终端运行
常见有以下几种，test.gjf是输入文件
g09 < test.gjf > test.out （信息都输出到test.out里。末尾可以再加上&令任务在后台运行）
g09 < test.gjf |tee test.out （信息输出到test.out的同时也同时输出到屏幕上）
g09 test.gjf （输出文件将默认为当前目录下的test.log）
大功告成 ![]() 参考资料： 欢迎转载，转载请注明来源： https://metaphorme.github.io/post/setup-gaussian09-and-gaussview6-on-macos/ 本作品采用 知识共享署名 4.0 国际许可协议 进行许可
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发表于 Post on 2022-3-8 19:38:43
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