[GROMACS] 求助：AWH模拟的设置问题（已解决

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发表于 Post on 2024-1-2 20:17:44 | 只看该作者 Only view this author 回帖奖励

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本帖最后由 wanzongliang 于 2024-1-6 13:35 编辑

各位老师好，我用gromacs带的AWH模拟进行PMF的测量，设置好mdp文件之后进行了500ns的模拟，原本是想模拟整个平面上的二维自由能景观，但模拟完之后取最后一帧发现x，y好像是分别得到了各自的PMF，而没有得到x，y平面上的自由能，请教一下各位老师我的问题出在哪（附上我的mdp文件以及分析得到的xvg文件

awh2.mdp

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awh1_t500000.xvg

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awh2_t500000.xvg

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