计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 11126|回复 Reply: 7
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[NBO相关] NBO分析中donor-acceptor 的转移电子数Delta q的公式

[复制链接 Copy URL]

117

帖子

0

威望

1126

eV
积分
1243

Level 4 (黑子)

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
麻烦大家看一下在NBO分析中donor-acceptor 的转移电子数的几个问题:
1. 焢萀汶式对吗? 见附件delta_q.png
2. 怎么得到的呢? 我知道627.51是为了统一单位kcal/mol
3.如果公式对的话, 焢萀绝对值越大,转移电子数越多的吧?

谢谢大家!

nbo1.png (20.97 KB, 下载次数 Times of downloads: 130)

nbo1.png

nbo2.png (5.91 KB, 下载次数 Times of downloads: 100)

nbo2.png

delta_q.png (2.26 KB, 下载次数 Times of downloads: 112)

delta_q.png

117

帖子

0

威望

1126

eV
积分
1243

Level 4 (黑子)

2#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2014-11-30 10:53:09 | 只看该作者 Only view this author
问题1出现了错误,不能显示特殊字符,应该是Delta q的公式对吗?见附件delta_q.png

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112496

管理员

公社社长

3#
发表于 Post on 2014-11-30 11:43:24 | 只看该作者 Only view this author
不对。见http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=102里面Natural Bond Orbital Methods.pdf中的公式18,那个才是对的。
不知道你的公式怎么来的,应当以那个帖子里的文档里的公式为准。

原则上数值越大转移量越大,但应当注意正确理解含义,NBO有很大局限性,而且要注意这种方式衡量电子转移数只是定性的。直接计算原子电荷求差值才是最好的作法。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

117

帖子

0

威望

1126

eV
积分
1243

Level 4 (黑子)

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2014-11-30 12:57:44 | 只看该作者 Only view this author
谢谢sobereva老师!

您说直接计算原子电荷求差值才是最好的作法,我想问一下,需要计算谁和谁的电荷然后求差值呢?怎样计算呢?

我想看一下分子内部电荷转移的情况,您说的这个原子电荷求差值可以实现吗?

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112496

管理员

公社社长

5#
发表于 Post on 2014-11-30 13:27:13 | 只看该作者 Only view this author
怎么求差值,这都要看实际体系,随机应变,没有实际体系没法说
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

117

帖子

0

威望

1126

eV
积分
1243

Level 4 (黑子)

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2014-11-30 16:01:29 | 只看该作者 Only view this author
附件中是用Gaussian算的两个不同时刻结构的.fchk文件,方法:#p b3lyp/6-31g(d) pop=nbo   电荷和自旋多重度是-1,2(贴敷一个电子)
一个是0fs,一个是60fs,我想看一下这个贴敷的电子是如何促使C-C键断裂的,或者这个贴敷电子在轨道之间是如何传递的?
我一开始的想法是分析NBO信息中的“Perturbation Theory Energy Analysis”部分,分析不同时刻结构中E(2)较强的一些轨道,所以想算出E(2)较强的一些轨道中转移电子数,来给出定性的分析。

当您提到“直接计算原子电荷求差值才是最好的作法”,我想用一个具体的例子来请教一下sobereva老师您说的这个方法该怎么做呢?

谢谢!

alde0fs.fchk

153.75 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

alde60fs.fchk

153.37 KB, 下载次数 Times of downloads: 3

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112496

管理员

公社社长

7#
发表于 Post on 2014-11-30 23:08:27 | 只看该作者 Only view this author
你可以考察-1和中性状态下原子电荷的差值,或者求密度差来绘图,这样多出来的一个电子怎么分布的就清楚了。你也可以计算这两个状态下的键级,以考察多一个电子是如何影响键的强弱的。
NBO的E2分析对这个问题没直接用处,不管你加不加这个电子,照样会给出CT值,何况这还是近似方式计算的,
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

117

帖子

0

威望

1126

eV
积分
1243

Level 4 (黑子)

8#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2014-12-1 10:31:05 | 只看该作者 Only view this author
非常感谢sobereva老师!谢谢!:)

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-27 06:38 , Processed in 0.199821 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list