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[CP2K] 请问大家有没有统计AIMD模拟轨迹中的水分子取向的VMD脚本?

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请问大家有没有统计AIMD模拟轨迹中的水分子取向的VMD脚本呢?

我想画出一张这样的图:在类似附件中模式图的体系中,二维催化剂表面的水分子取向分布。

谢谢各位!

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截屏2025-10-16 15.36.38.png

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公社社长

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发表于 Post on 2025-10-17 03:48:57 | 只看该作者 Only view this author
gromacs里有h2order命令可以借用

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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-10-17 18:17:39 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-10-17 03:48
gromacs里有h2order命令可以借用

参考北京科音分子动力学与GROMACS培训班(http://www.keinsci.com/KGMX ...

谢谢社长

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