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[波函数分析求助] 请问分析闭壳层的电荷转移,用什么电荷分析比较合适?

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体系为包含镍原子的一百多个原子的分子,所用方法基组为# b3lyp/genecp opt freq em=gd3
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发表于 Post on 2023-2-21 02:59:11 | 只看该作者 Only view this author
说具体电荷转移指什么,谁向谁转移、由什么导致的转移
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-2-21 09:10:04 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-2-21 02:59
说具体电荷转移指什么,谁向谁转移、由什么导致的转移

分析片段间的电荷转移,想具体分析一下电荷从哪部分流向哪部分,
      这是个氢转移过渡态,我用Hirshfeld 分析了片段间的氢转移,发现整体电荷变化不明显,体系是闭壳层体系,闭壳层不可能转移自由基,氢片段的电荷接近零,把它描述成正电负电都不太合适,不知道这能不能描述成电子重排?
      不知道是不是选择的电荷不适合分析这个体系导致的这种情况,请老师赐教

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发表于 Post on 2023-2-21 10:02:09 | 只看该作者 Only view this author
wangxiaofeng 发表于 2023-2-21 09:10
分析片段间的电荷转移,想具体分析一下电荷从哪部分流向哪部分,
      这是个氢转移过渡态,我用Hirshf ...

我觉得先做电子密度图定性去看电荷流向,然后用NPA电荷计算流向

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-2-21 11:05:02 | 只看该作者 Only view this author
七尺贱 发表于 2023-2-21 10:02
我觉得先做电子密度图定性去看电荷流向,然后用NPA电荷计算流向

好的,谢谢!您说的电子密度图是指密度差图吗?

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发表于 Post on 2023-2-21 13:22:53 | 只看该作者 Only view this author
wangxiaofeng 发表于 2023-2-21 11:05
好的,谢谢!您说的电子密度图是指密度差图吗?

此文说的密度差图
使用Multiwfn作电子密度差图
http://sobereva.com/113

但密度差图正负部分交错,有时候并不容易考察。对于某些类型的体系可以再用Multiwfn绘制密度差积分曲线帮助讨论,看下文
使用CP2K结合Multiwfn绘制密度差图、平面平均密度差曲线和电荷位移曲线
http://sobereva.com/638http://bbs.keinsci.com/thread-28225-1-1.html

至于基于原子电荷定量讨论,注意此时指的是片段的净电荷,即片段里所有原子电荷的加和,计算例子如:
使用Multiwfn计算分子的某个片段的电荷
https://www.bilibili.com/video/av26312703/
视频里演示的是计算ADCH原子电荷对应的片段电荷,用Multiwfn里其它原子电荷方法计算片段电荷的过程也类似,计算原子电荷之前先定义个片段即可

另外,以前写过个文章,可能与你的研究有一定联系
谈谈质子转移、氢原子转移、氢负离子转移的关系
http://sobereva.com/626
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