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[Multiwfn使用咨询] 关于AdNDP分析的求助

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想求助同一多中心键怎么展示在同一个图上呢,即比如说二中心键有18个,怎么将18个二中心键都在一个图上展示出来(我附上几张文献上的图展示一下我的意思),这是有什么软件还是multiwfn能直接展示出来的呢,手册上内容很多不知道怎么下手找方法,网上搜也没找到方法,有知道的朋友可以指指路吗,非常感谢


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发表于 Post on 2023-2-15 05:59:03 | 只看该作者 Only view this author
使用AdNDP方法以及ELF/LOL、多中心键级研究多中心键
http://sobereva.com/138

说得非常清楚了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-2-17 11:29:05 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-2-15 05:59
使用AdNDP方法以及ELF/LOL、多中心键级研究多中心键
http://sobereva.com/138

好的,谢谢sob老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-2-25 14:03:19 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-2-15 05:59
使用AdNDP方法以及ELF/LOL、多中心键级研究多中心键
http://sobereva.com/138

老师,我操作过程中一直显示读取不了文件,我把轨道的cube文件放在vmd和multiwfn同一个路径下都不能,现在转不过来弯来,能麻烦您指点我一下吗
这是导入VMD窗口的指令:
color Display Background white
display depthcue off
display rendermode GLSL
for {set i $istart} {$i<=$iend} {incr i 1} {
set idx [format %04d $i]
set name " D:\\study\\Multiwfn"
puts Loading\ $name
mol new $name type {cube}
mol modstyle 0 $idinit Isosurface $isoval 0 0 0 1 1
mol modcolor 0 $idinit ColorID $posclr
mol modmaterial 0 $idinit Transparent
mol addrep $idinit
mol modstyle 1 $idinit Isosurface -$isoval 0 0 0 1 1
mol modcolor 1 $idinit ColorID $negclr
mol modmaterial 1 $idinit Transparent
incr idinit 1

这是VMD中的报错:
Loading  D:\study\Multiwfn
ERROR) Could not read file  D:\study\Multiwfn
Unable to load file ' D:\study\Multiwfn' using file type 'cube'.

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发表于 Post on 2023-2-26 03:13:51 | 只看该作者 Only view this author
XiaoZeng 发表于 2023-2-25 14:03
老师,我操作过程中一直显示读取不了文件,我把轨道的cube文件放在vmd和multiwfn同一个路径下都不能,现 ...

D:\study\Multiwfn是目录名,又不是cub文件名,VMD能当成文件载入就怪了。根据脚本内容和提示理解,不可能解决不了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-2-26 13:47:47 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-2-26 03:13
D:\study\Multiwfn是目录名,又不是cub文件名,VMD能当成文件载入就怪了。根据脚本内容和提示理解,不可 ...

老师您的意思是要画AdNDPorb0001.cub的话要输入的路径应该是D:\\study\\Multiwfn\\AdNDPorb0001.cub吗,要将很多轨道做到一张图上是要将cub的路径都加进去吗

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发表于 Post on 2023-2-27 04:00:55 | 只看该作者 Only view this author
XiaoZeng 发表于 2023-2-26 13:47
老师您的意思是要画AdNDPorb0001.cub的话要输入的路径应该是D:\\study\\Multiwfn\\AdNDPorb0001.cub吗,要 ...



在脚本里依次载入各个cub文件,然后都显示成等值面

仔细看下文提供的脚本内容理解机制
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-2-27 09:37:34 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-2-27 04:00


在脚本里依次载入各个cub文件,然后都显示成等值面

好的,谢谢老师

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