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[GROMACS] 生成rdf.xvg时中途中断

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我所模拟的是1分子V6O7(OC2H5)12 在100个[NBu4][PF6]、1650个乙腈溶剂分子中10ns的NVT,我想对比一下他和V6O7(OCH3)12与溶剂分子和抗衡离子的相互作用,于是打算作出其中乙基最外端的H与抗衡离子的N 和 溶剂分子中的C 的RDF。在输入命令后,出现下述现象,突然终结。 请问各位老师,出现这种情况怎么处理呢?

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发表于 Post on 2023-2-28 06:33:37 | 只看该作者 Only view this author
换个gmx版本再试,或者换个等价的选择语句的写法再试。都不行的话干脆用VMD的rdf计算功能
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-2-28 08:41:55 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-2-28 06:33
换个gmx版本再试,或者换个等价的选择语句的写法再试。都不行的话干脆用VMD的rdf计算功能

好的 感谢sob老师

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