如何构建固体碱催化剂簇模型

科研好难 · 发表于 Post on 2023-3-15 22:09:10

各位老师好，我想在Gaussian中加入固体碱催化剂，了解到一般是以簇模型方式加入的，请问一般用什么构建簇模型比较方便快捷，我是刚接触计算化学的，基础太差，还请各位老师指点一下，谢谢！

wzkchem5 · 发表于 Post on 2023-3-15 22:42:59

问题背景提供得不够，仔细阅读http://sobereva.com/620了解必须把问题背景提供到什么样的详细程度，别人才能回答

sobereva · 发表于 Post on 2023-3-15 23:32:03

说具体固体碱催化剂的化学组成，最好给个结构图，以及具体算什么问题。说不定本来就不适合用簇模型，而适合CP2K等第一性原理程序当周期性体系算

科研好难 · 发表于 Post on 2023-3-16 11:39:09

sobereva 发表于 2023-3-15 23:32
说具体固体碱催化剂的化学组成，最好给个结构图，以及具体算什么问题。说不定本来就不适合用簇模型，而适合 ...

老师您好，我是要在Gaussian中运用DFT计算木质素在固体碱催化剂催化作用下的反应路径机理，催化剂的话可能会用到多种（比如CaO，MgO-Al2O3)，论坛看了一些类似帖子说固体碱催化剂一般是团簇，看了一些类似文献是做成分子结构在Gaussian中计算的，麻烦老师再指点一下，感谢。

科研好难 · 发表于 Post on 2023-3-16 11:40:12

wzkchem5 发表于 2023-3-15 22:42
问题背景提供得不够，仔细阅读http://sobereva.com/620了解必须把问题背景提供到什么样的详细程度，别人才 ...

不好意思老师，我把确定的再补充一下，我是要在Gaussian中运用DFT计算木质素在固体碱催化剂催化作用下的反应路径机理，催化剂的话可能会用到多种（比如CaO，MgO-Al2O3)，论坛看了一些类似帖子说固体碱催化剂一般是团簇，看了一些类似文献是做成分子结构在Gaussian中计算的，麻烦老师再指点一下，感谢。

wzkchem5 · 发表于 Post on 2023-3-16 16:00:36

科研好难发表于 2023-3-16 04:40
不好意思老师，我把确定的再补充一下，我是要在Gaussian中运用DFT计算木质素在固体碱催化剂催化作用下的 ...

先确定这个团簇暴露哪个晶面，表面有没有羟基和吸附水，如果有的话有多少。这些问题是主要的难点，相比之下建模不算啥问题。

sobereva · 发表于 Post on 2023-3-17 02:53:54

科研好难发表于 2023-3-16 11:39
老师您好，我是要在Gaussian中运用DFT计算木质素在固体碱催化剂催化作用下的反应路径机理，催化剂的话可 ...

这种体系当周期性计算更好，用簇模型还得设背景电荷、capped ECP，比较麻烦。CP2K算表面催化反应的文章大把

科研好难 · 发表于 Post on 2023-3-17 11:06:21

sobereva 发表于 2023-3-17 02:53
这种体系当周期性计算更好，用簇模型还得设背景电荷、capped ECP，比较麻烦。CP2K算表面催化反应的文章大 ...

好的，谢谢老师，我先试着处理一下簇模型，毕竟到这一步也做了很多准备

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