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[Gaussian/gview] GaussView在使用溶剂效应优化后Results里PCM Solvation Cavity显示是灰色的

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GaussView在使用溶剂效应优化后Results里PCM Solvation Cavity显示是灰色的

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发表于 Post on 2023-3-11 22:26:26 | 只看该作者 Only view this author
说具体GaussView和Gaussian的版本
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发表于 Post on 2023-3-12 12:34:31 | 只看该作者 Only view this author
那个在fchk里才有,溶剂表面不记录在.out/.log文件里

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发表于 Post on 2023-3-12 23:29:20 | 只看该作者 Only view this author
喵星大佬 发表于 2023-3-12 12:34
那个在fchk里才有,溶剂表面不记录在.out/.log文件里

GaussView 6.0.16打开用了scrf的out文件直接就能看,显示的时候利用了输出文件里Spheres list部分的原子球半径(Re0)信息来显示范德华球叠加的孔洞表面
后来的6.1.1版规则改了:GaussView’s solvation cavity display feature requires that the Gaussian job be run with the SCRF=Read Gaussian route section option and that the input file include the PrintSpheres within the SCRF additional input section. Previous documentation referred to the PDens SCRF input item
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-13 15:50:33 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-3-11 22:26
说具体GaussView和Gaussian的版本

GaussView6.0 Gaussian16w

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-13 15:53:49 | 只看该作者 Only view this author
喵星大佬 发表于 2023-3-12 12:34
那个在fchk里才有,溶剂表面不记录在.out/.log文件里

刚刚试过了,还是不行,谢谢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-13 16:01:14 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-3-12 23:29
GaussView 6.0.16打开用了scrf的out文件直接就能看,显示的时候利用了输出文件里Spheres list部分的原子 ...

我在想是不是我设置的有问题
%nprocshared=40
%mem=80GB
%chk=Preview_smglc.chk
# opt freq pm6 scrf=(iefpcm,solvent=generic,read) pressure=0.3
temperature=443

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发表于 Post on 2023-3-13 21:44:02 | 只看该作者 Only view this author
lichenchen 发表于 2023-3-13 16:01
我在想是不是我设置的有问题
%nprocshared=40
%mem=80GB

去掉solvent=generic,read
不要就写个GaussView6.0 Gaussian16w,把具体修订版写清楚
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-15 15:17:19 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-3-13 21:44
去掉solvent=generic,read
不要就写个GaussView6.0 Gaussian16w,把具体修订版写清楚

谢谢老师,发现去掉solvent=generic,read也去掉了后边自定义的混合溶剂介电常数esp和espinf是可以看了PCM Solvation Cavity

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