NVT系综下，用gromacs模拟电解质水溶液时离子聚集怎么解决？

qiezi666 · 发表于 Post on 2023-3-16 11:25:43

各位老师好！NVT系综下，用gromacs模拟LiCl水溶液(OPLS-AA力场，SPC/E水模型，离子和水的势参数用的力场自带的)，跑完平衡相后检查gro文件，发现出现离子聚集应该怎么解决？能量最小化后得到的em.gro结构文件中离子未聚集。

牧生 · 发表于 Post on 2023-3-16 12:04:07

qiezi666 · 发表于 Post on 2023-3-16 13:46:36

牧生发表于 2023-3-16 12:04
http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=30826&highlight=%BE%DB%BC%AF

感谢老师！

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[GROMACS] NVT系综下，用gromacs模拟电解质水溶液时离子聚集怎么解决？